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Enregistrement W2527156068 · doi:10.1002/pro.3053

Structural characterization reveals a novel bilobed architecture for the ectodomains of insect stage expressed <i>Trypanosoma brucei</i> PSSA‐2 and <i>Trypanosoma congolense</i> ISA

2016· article· en· W2527156068 sur OpenAlexafffund
Raghavendran Ramaswamy, Sarah Goomeshi Nobary, Brett A. Eyford, Terry W. Pearson, Martin J. Boulanger

Notice bibliographique

RevueProtein Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTrypanosoma species research and implications
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésTrypanosoma bruceiBiologyTrypanosomaVector (molecular biology)African trypanosomiasisVirologyCell biologyTrypanosomiasisGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

African trypanosomiasis, caused by parasites of the genus Trypanosoma, is a complex of devastating vector-borne diseases of humans and livestock in sub-Saharan Africa. Central to the pathogenesis of African trypanosomes is their transmission by the arthropod vector, Glossina spp. (tsetse fly). Intriguingly, the efficiency of parasite transmission through the vector is reduced following depletion of Trypanosoma brucei Procyclic-Specific Surface Antigen-2 (TbPSSA-2). To investigate the underlying molecular mechanism of TbPSSA-2, we determined the crystal structures of its ectodomain and that of its homolog T. congolense Insect Stage Antigen (TcISA) to resolutions of 1.65 Å and 2.45 Å, respectively using single wavelength anomalous dispersion. Both proteins adopt a novel bilobed architecture with the individual lobes displaying rotational flexibility around the central tether that suggest a potential mechanism for coordinating a binding partner. In support of this hypothesis, electron density consistent with a bound peptide was observed in the inter-lob cleft of a TcISA monomer. These first reported structures of insect stage transmembrane proteins expressed by African trypanosomes provide potentially valuable insight into the interface between parasite and tsetse vector.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,339
Score d'incertitude au seuil0,683

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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