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Enregistrement W2527276262 · doi:10.1086/688675

Mutualism Persistence and Abandonment during the Evolution of the Mycorrhizal Symbiosis

2016· article· en· W2527276262 sur OpenAlexaff
Hafiz Maherali, Brad Oberle, Peter F. Stevens, William K. Cornwell, Daniel J. McGlinn

Notice bibliographique

RevueThe American Naturalist · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNational Evolutionary Synthesis Center
Mots-clésMutualism (biology)SymbiosisBiologyCoevolutionNatural selectionEcologyEvolutionary biologyBacteriaSelection (genetic algorithm)Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutualistic symbioses with mycorrhizal fungi are widespread in plants. The majority of plant species associate with arbuscular mycorrhizal (AM) fungi. By contrast, the minority associate with ectomycorrhizal (EM) fungi, have abandoned the symbiosis and are nonmycorrhizal (NM), or engage in an intermediate, weakly AM symbiosis (AMNM). To understand the processes that maintain the mycorrhizal symbiosis or cause its loss, we reconstructed its evolution using a ∼3,000-species seed plant phylogeny integrated with mycorrhizal state information. Reconstruction indicated that the common ancestor of seed plants most likely associated with AM fungi and that the EM, NM, and AMNM states descended from the AM state. Direct transitions from the AM state to the EM and NM states were infrequent and generally irreversible, implying that natural selection or genetic constraint could promote stasis once a particular state evolved. However, the evolution of the NM state was more frequent via an indirect pathway through the AMNM state, suggesting that weakening of the AM symbiosis is a necessary precursor to mutualism abandonment. Nevertheless, reversions from the AMNM state back to the AM state were an order of magnitude more likely than transitions to the NM state, suggesting that natural selection favors the AM symbiosis over mutualism abandonment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,179
Écart entre enseignants0,173 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations123
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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