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Enregistrement W2527468127 · doi:10.1186/s13104-016-2258-1

Infrared-emitting, peptidase-resistant fluorescent ligands of the bradykinin B2 receptor: application to cytofluorometry and imaging

2016· article· en· W2527468127 sur OpenAlexafffund
Lajos Gera, Xavier Charest‐Morin, Mélissa Jean, Hélène Bachelard, François Marceau

Notice bibliographique

RevueBMC Research Notes · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCoagulation, Bradykinin, Polyphosphates, and Angioedema
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de QuébecUniversité Laval
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAgonistBradykininChemistryMolecular biologyBiophysicsReceptorFluorescenceFluorophoreConfocal microscopyCyanineBiochemistryCell biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously reported the design, pharmacological properties and imaging application of bradykinin (BK) B2 receptor (B2R) ligands conjugated with fluorophores such as fluorescein derivatives at their N-terminus. To take advantage of the high penetration of infrared light into living tissues and their low autofluorescence in this region of the spectrum, additional probes conjugated with cyanine dye 7 (Cy7) were synthesized and characterized. The antagonist B-9430 (D-Arg-[Hyp3,Igl5,D-Igl7,Oic8]-BK) and the agonist B-9972 (D-Arg-[Hyp3,Igl5,Oic7,Igl8]-BK) were N-terminally extended with the infrared fluorophore Cy7, producing the peptides B-10665 and B-10666, respectively. Pharmacological studies indicated that the agonist B-10666 lost much affinity for the B2R vs. the parent peptide, whereas the antagonist B-10665 better retained its potency vs. B-9430 (competition of [3H]BK binding to human B2R, contractility of the human isolated umbilical vein for which potency losses were more important in each case). Both probes stained HEK 293 cells that expressed the B2R-green fluorescent protein (GFP) construction in a specific manner (confocal microscopy) and with very extensive co-localization of the green and infrared fluorescence in either case. The agonist B-10666 at 100 nM promoted the endocytosis of B2R-GFP in live cells, but not the antagonist version at 10–25 nM. The Cy7-labeled peptides did not label cells expressing the β2-adrenoceptor-GFP construction. B-10665 at low nanomolar concentrations was an effective probe for the recombinant B2Rs in cytofluorometry and macroscopic imaging of cell wells (IVIS imaging system operated for infrared fluorescence detection). Despite a propensity for non-specific binding when used at high concentrations and limited sensitivity, Cy7-conjugated peptidase-resistant B2R ligands support original imaging and cytofluorometric applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,089
Score d'incertitude au seuil0,410

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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