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Enregistrement W2527998767 · doi:10.1091/mbc.e16-05-0281

Glutathione depletion activates the yeast vacuolar transient receptor potential channel, Yvc1p, by reversible glutathionylation of specific cysteines

2016· article· en· W2527998767 sur OpenAlexaff
Avinash Chandel, Krishna K. Das, Anand Bachhawat

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesIndian Institute of Science Education and Research MohaliCouncil of Scientific and Industrial Research, IndiaUniversity of Wisconsin-Madison
Mots-clésGlutathioneBiologyCysteineCell biologyYeastCytoplasmTransient receptor potential channelBiochemistryTransmembrane domainSaccharomyces cerevisiaeThioredoxinReceptorOxidative stressEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glutathione depletion and calcium influx into the cytoplasm are two hallmarks of apoptosis. We have been investigating how glutathione depletion leads to apoptosis in yeast. We show here that glutathione depletion in yeast leads to the activation of two cytoplasmically inward-facing channels: the plasma membrane, Cch1p, and the vacuolar calcium channel, Yvc1p. Deletion of these channels partially rescues cells from glutathione depletion-induced cell death. Subsequent investigations on the Yvc1p channel, a homologue of the mammalian TRP channels, revealed that the channel is activated by glutathionylation. Yvc1p has nine cysteine residues, of which eight are located in the cytoplasmic regions and one on the transmembrane domain. We show that three of these cysteines, Cys-17, Cys-79, and Cys-191, are specifically glutathionylated. Mutation of these cysteines to alanine leads to a loss in glutathionylation and a concomitant loss in calcium channel activity. We further investigated the mechanism of glutathionylation and demonstrate a role for the yeast glutathione S-transferase Gtt1p in glutathionylation. Yvc1p is also deglutathionylated, and this was found to be mediated by the yeast thioredoxin, Trx2p. A model for redox activation and deactivation of the yeast Yvc1p channel is presented.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,094
Score d'incertitude au seuil0,328

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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