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Enregistrement W2528106982 · doi:10.1101/076521

Dynamic forecasting of Zika epidemics using Google Trends

2016· preprint· en· W2528106982 sur OpenAlexaff
Yue Teng, Dehua Bi, Guigang Xie, Yuan Jin, Baihan Lin, Dan Feng

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueData-Driven Disease Surveillance
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutoregressive integrated moving averageZika virusAutoregressive modelOutbreakWarning systemComputer scienceTime seriesData miningStatisticsGeographyMedicineMachine learningVirologyMathematicsVirusTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We developed a dynamic forecasting model for Zika virus (ZIKV), based on real-time online search data from Google Trends (GTs). It was designed to provide Zika virus disease (ZVD) surveillance for Health Departments with early warning, and predictions of numbers of infection cases, which would allow them sufficient time to implement interventions. We used correlation data from ZIKV epidemics and Zika-related online search in GTs between 12 February and 25 August 2016 to construct an autoregressive integrated moving average (ARIMA) model (0, 1, 3) for the dynamic estimation of ZIKV outbreaks. The online search data acted as an external regressor in the forecasting model, and was used with the historical ZVD epidemic data to improve the quality of the predictions of disease outbreaks. Our results showed a strong correlation between Zika-related GTs and the cumulative numbers of reported cases, both confirmed and suspected (both p<0.001 ; Pearson Product-Moment Correlation analysis). The predictive cumulative numbers of confirmed and suspected cases increased steadily to reach 148,510 (95% CI: 126,826-170,195) and 602,721 (95% CI: 582,753-622,689), respectively, in 21 October 2016. Integer-valued autoregression provides a useful base predictive model for ZVD cases. This is enhanced by the incorporation of GTs data, confirming the prognostic utility of search query based surveillance. This accessible and flexible dynamic forecast model could be used in the monitoring of ZVD to provide advanced warning of future ZIKV outbreaks.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,712
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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