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Enregistrement W2528116814 · doi:10.1210/jc.2016-1665

A <i>SDHC</i> Founder Mutation Causes Paragangliomas (PGLs) in the French Canadians: New Insights on the <i>SDHC</i>-Related PGL

2016· article· en· W2528116814 sur OpenAlexaffabout
Isabelle Bourdeau, Solange Grunenwald, Nelly Burnichon, Emmanuel Khalifa, Nadine Dumas, Marie-Claire Binet, Serge Nolet, Anne‐Paule Gimenez‐Roqueplo

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdrenal and Paraganglionic Tumors
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSDHDSDHBGeneticsGermline mutationMutationParagangliomaGermlineExonMedicineNonsense mutationGeneBiologyPathologyMissense mutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: More than 40% of patients with paragangliomas (PGLs) harbor a germline mutation of the known PGL susceptibility genes, mainly in the SDHB or SDHD genes. OBJECTIVE: The objective of the study was to characterize the genetic background of the French Canadian (FC) patients with PGLs and provide new clinical and paraclinical insights on SDHC-related PGLs. METHODS: Genetic testing has been offered to FC patients affected with PGLs followed up at the adrenal genetics clinic at Centre hospitalier de l'Université de Montréal. After genetic counseling, 29 FC patients consented for PGL genetic testing. RESULTS: Thirteen of 29 patients (44.8%) carried a germline mutation. The same heterozygous nonsense mutation at codon 133 of exon 5 of the SDHC gene (c.397C>T, p.[Arg133Ter]) was found in nine patients, representing 69.2% of the patients having a germline mutation. Seventy percent of these patients had head and neck PGLs. Twenty percent had multiple and 30% had malignant PGLs. We traced back the ascending genealogy of 10 index cases (nine patients from our cohort and one patient referred to us) and found that this mutation was most probably introduced in Nouvelle France by a couple of French settlers who established themselves in the 17th century. CONCLUSIONS: We found that 31% of the PGLs in the French Canadian can be explained by the SDHC mutation (c.397C>T, p.[Arg133Ter]). The dominance of the SDHC mutation is unique to the FCs and is most likely due to a French founder effect. SDHC gene analysis should be prioritized in FC patients with PGL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,565
Score d'incertitude au seuil0,701

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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