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Enregistrement W2528220525 · doi:10.1038/srep34494

A proteinaceous organic matrix regulates carbonate mineral production in the marine teleost intestine

2016· article· en· W2528220525 sur OpenAlexaff
Kevin L. Schauer, Christophe M. R. LeMoine, Adrian Pelin, Nicolas Corradi, M. Danielle McDonald, Wesley C. Warren, Martin Grosell

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueCalcium Carbonate Crystallization and Inhibition
Établissements canadiensBrandon UniversityUniversity of OttawaCanadian Institute for Advanced Research
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesColorado State UniversityUniversity of MiamiNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésMatrix (chemical analysis)ToadfishTranscriptomeBiologyChemistryBiochemistryIn vitroFish <Actinopterygii>GeneChromatographyGene expressionFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Marine teleost fish produce CaCO 3 in their intestine as part of their osmoregulatory strategy. This precipitation is critical for rehydration and survival of the largest vertebrate group on earth, yet the molecular mechanisms that regulate this reaction are unknown. Here, we isolate and characterize an organic matrix associated with the intestinal precipitates produced by Gulf toadfish ( Opsanus beta ). Toadfish precipitates were purified using two different methods, and the associated organic matrix was extracted. Greater than 150 proteins were identified in the isolated matrix by mass spectrometry and subsequent database searching using an O. beta transcriptomic sequence library produced here. Many of the identified proteins were enriched in the matrix compared to the intestinal fluid, and three showed no substantial homology to any previously characterized protein in the NCBI database. To test the functionality of the isolated matrix, a micro-modified in vitro calcification assay was designed, which revealed that low concentrations of isolated matrix substantially promoted CaCO 3 production, where high concentrations showed an inhibitory effect. High concentrations of matrix also decreased the incorporation of magnesium into the forming mineral, potentially providing an explanation for the variability in magnesium content observed in precipitates produced by different fish species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,866

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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