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Enregistrement W2528305148 · doi:10.1080/15476286.2016.1240143

Post-transcriptional mending of gene sequences: Looking under the hood of mitochondrial gene expression in diplonemids

2016· review· en· W2528305148 sur OpenAlex
Matus Valach, Sandrine Moreira, Drahomíra Faktorová, Julius Lukeš, Gertraud Burger

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueRNA Biology · 2016
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtist diversity and phylogeny
Établissements canadiensCanadian Institute for Advanced ResearchUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyGeneRNA splicingGeneticsTrans-splicingRNA editingGene expressionAlternative splicingComputational biologyRNARegulation of gene expressionRNA interferenceIntronExon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The instructions to make proteins and structural RNAs are laid down in gene sequences. Yet, in certain instances, these primary instructions need to be modified considerably during gene expression, most often at the transcript level. Here we review a case of massive post-transcriptional revisions via trans-splicing and RNA editing, a phenomenon occurring in mitochondria of a recently recognized protist group, the diplonemids. As of now, the various post-transcriptional steps have been cataloged in detail, but how these processes function is still unknown. Since genetic manipulation techniques such as gene replacement and RNA interference have not yet been established for these organisms, alternative strategies have to be deployed. Here, we discuss the experimental and bioinformatics approaches that promise to unravel the molecular machineries of trans-splicing and RNA editing in Diplonema mitochondria.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,381
Score d'incertitude au seuil0,618

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle