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Enregistrement W2528459578

Selective killing of RAD54B-deficient colorectal cancer cells through SOD1 inhibition

2013· article· en· W2528459578 sur OpenAlexaff
Kirk J McManus Babu V Sajesh, Zelda Lichtensztejn

Notice bibliographique

RevueJournal of Stem Cell Research & Therapy · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSynthetic lethalityCancer researchColorectal cancerBiologyProstate cancerSOD1CancerDNA repairDNA damageCancer cellCell cycleGeneticsDNAGeneMutant
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

C cancer (CRC) affects both males and females, and is the second leading cause of cancer-related deaths in North America. Novel insight into the disease is highly warranted so that new therapeutic approaches can be developed. Synthetic lethality refers to the lethal combination of 2 independently viable mutations and has been extensively studied in model organisms such as yeast. Recently, synthetic lethality has been applied in cancer contexts and is beginning to show potential as a new therapeutic modality. RAD54B is an excellent candidate for therapeutic targeting as it is mutated in CRC and numerous other tumor types. RAD54B is an evolutionarily conserved protein that functions in DNA repair and is essential for chromosome stability. RAD54B deficiencies cause chromosome instability, which we believe can be targeted through a synthetic lethal approach. Utilizing cross-species approaches, 80 candidate synthetic lethal interactors of RAD54B were subjected to an RNAi-based highcontent screen in human cells. Subsequent direct tests validated an interaction between RAD54B and superoxide dismutase 1 (SOD1) in both CRC cells and immortalized fibroblasts. Real-time cell analyses showed that chemical inhibitors are able to selectively kill RAD54B-deficient cells and demonstrated the decreases in cell numbers observed is due to cellular cytotoxicity rather than cell cycle arrest. Thus, we have identified and validated SOD1 as a novel candidate therapeutic target for the treatment of RAD54B-deficient CRCs cells. These data have far reaching implications as RAD54B defects have been identified in numerous tumor types including, prostate, ovarian, bladder and breast. Kirk J. McManus et al., J Stem Cell Res Ther 2013, 3:5 http://dx.doi.org/10.4172/2157-7633.S1.010

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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