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Enregistrement W2528857580 · doi:10.1021/acs.jproteome.6b00212

Quantitative Protein Sulfenic Acid Analysis Identifies Platelet Releasate-Induced Activation of Integrin β<sub>2</sub> on Monocytes via NADPH Oxidase

2016· article· en· W2528857580 sur OpenAlexafffund
Ru Li, Cordula Klockenbusch, Liwen Lin, Honghui Jiang, Shujun Lin, Juergen Kast

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSulfenic acidNADPH oxidaseChemistryPlatelet activationIntegrinBiochemistryPlateletOxidase testCell biologyEnzymeBiologyImmunologyCellCysteine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Physiological stimuli such as thrombin, or pathological stimuli such as lysophosphatidic acid (LPA), activate platelets. The activated platelets bind to monocytes through P-selectin–PSGL-1 interactions but also release the contents of their granules, commonly called “platelet releasate”. It is known that monocytes in contact with platelet releasate produce reactive oxygen species (ROS). Reversible cysteine oxidation by ROS is considered to be a potential regulator of protein function. In a previous study, we used THP-1 monocytic cells exposed to LPA- or thrombin-induced platelet releasate and a modified biotin switch assay to unravel the biological processes that are influenced by reversible cysteine oxidation. To gain a better understanding of the redox regulation of monocytes in atherosclerosis, we have now altered the modified biotin switch to selectively quantify protein sulfenic acid, a subpopulation of reversible cysteine oxidation. Using arsenite as reducing agent in the modified biotin switch assay, we were able to quantify 1161 proteins, in which more than 100 sulfenic acid sites were identified. Bioinformatics analysis of the quantified sulfenic acid sites highlighted the relevant, previously missed biological process of monocyte transendothelial migration, which included integrin β 2 . Flow cytometry validated the activation of LFA-1 (α L β 2 ) and Mac-1 (α M β 2 ), two subfamilies of integrin β 2 complexes, on human primary monocytes following platelet releasate treatment. The activation of LFA-1 was mediated by ROS from NADPH oxidase (NOX) activation. Production of ROS and activation of LFA-1 in human primary monocytes were independent of P-selectin–PSGL-1 interaction. Our results proved the modified biotin switch assay to be a powerful tool with the ability to reveal new regulatory mechanisms and identify new therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,861

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,087
Tête enseignante GPT0,387
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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