<b>A computer program to simplify analysis of mass scan data of organometallic compounds from high‐resolution mass spectrometers</b>
Notice bibliographique
Résumé
RATIONALE: Software accompanying high-resolution mass spectrometers, particularly that used for the analysis of organometallic compounds, has lagged the technology of the instruments themselves. We have developed a computer program that partially fills this gap. METHODS: Given the user's expectation for the number of atoms of a target element likely to be in an ion, the program calculates isotopologue mass differences for combinations of that element's isotopes and their expected intensity ratios relative to the most abundant isotopologue. These values are compared with mass differences and intensity ratios found in the experimental mass scan data and these metrics feed into a four-factor scoring model which ranks the ions as to the likelihood of each containing the specified number of the target atoms. The program was tested using experimental data obtained for selenomethionine. RESULTS: Across a broad range of sample concentrations, the program consistently ranked selenomethionine at or near the top of the list of ions that passed the screening and ranking process. Mass scan data files in excess of 24,000 records were analyzed in less than one second. CONCLUSIONS: The program is quick and efficient at scanning voluminous experimental data files for the presence of ions containing the expected number of atoms of a target element. Best results were obtained the scarcer the target element and the more isotopes it comprised. Copyright © 2016 John Wiley & Sons, Ltd.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,036 | 0,027 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».