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Enregistrement W2528893335 · doi:10.1242/dev.140889

Reversible optogenetic control of kinase activity during differentiation and embryonic development

2016· article· en· W2528893335 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLight effects on plants
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignNational Institutes of HealthMcMaster University
Mots-clésOptogeneticsBiologyCryptochromeMulticellular organismCell biologySignal transductionXenopusMAPK/ERK pathwayNeuroscienceCellCircadian clockGeneticsCircadian rhythm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A limited number of signaling pathways are repeatedly used to regulate a wide variety of processes during development and differentiation. The lack of tools to manipulate signaling pathways dynamically in space and time has been a major technical challenge for biologists. Optogenetic techniques, which utilize light to control protein functions in a reversible fashion, hold promise for modulating intracellular signaling networks with high spatial and temporal resolution. Applications of optogenetics in multicellular organisms, however, have not been widely reported. Here, we create an optimized bicistronic optogenetic system using Arabidopsis thaliana cryptochrome 2 (CRY2) protein and the N-terminal domain of cryptochrome-interacting basic-helix-loop-helix (CIBN). In a proof-of-principle study, we develop an optogenetic Raf kinase that allows reversible light-controlled activation of the Raf/MEK/ERK signaling cascade. In PC12 cells, this system significantly improves light-induced cell differentiation compared with co-transfection. When applied to Xenopus embryos, this system enables blue light-dependent reversible Raf activation at any desired developmental stage in specific cell lineages. Our system offers a powerful optogenetic tool suitable for manipulation of signaling pathways with high spatial and temporal resolution in a wide range of experimental settings.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,506
Score d'incertitude au seuil0,153

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle