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Enregistrement W2529258950 · doi:10.1111/ppa.12629

Fungal derived cytokinins are necessary for normal <i>Ustilago maydis</i> infection of maize

2016· article· en· W2529258950 sur OpenAlexafffund
Erin N. Morrison, R. J. Neil Emery, Barry Saville

Notice bibliographique

RevuePlant Pathology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensTrent University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésUstilagoBiologySmutPathogenGenePathosystemVirulenceFungusMutantGeneticsMicrobiologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phytohormones derived from fungi play a key role in regulating plant–pathogen interactions; however, deciphering the separate contributions of pathogen and plant during infection has been difficult. Here, the Ustilago maydis–Zea mays pathosystem was used to investigate this chemical exchange. Ustilago maydis , the causative agent of maize smut, produces cytokinins ( CK ), which are a group of phytohormones responsible for directing plant development. The characteristic symptom of smut disease is the formation of tumours composed of plant and fungal tissue. Isopentenyltransferase ( IPT ) catalyses the rate‐limiting step in CK biosynthesis, and U. maydis strains in which the sole tRNA ‐ipt gene was deleted no longer produced CK s. These deletion strains elicited fewer, smaller tumours than the pathogenic strain SG 200. High performance liquid chromatography‐electrospray ionization tandem mass spectrometry ( HPLC ‐ ESI MS / MS ) was used to detect and quantify phytohormone levels in infected tissue. This revealed that key hormone changes in SG 200 infections were not present in infections by deletion strains, suggesting that CK production by U. maydis is required for the altered phytohormone profile in infected tissue relative to uninfected tissue. Separate analyses indicated that U. maydis tRNA ‐ipt mutants might be altered in their ability to metabolize CK s taken up from the environment. Mining the U. maydis genome identified genes encoding putative CK signalling and biosynthesis proteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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