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Enregistrement W2529555756 · doi:10.1074/jbc.m116.749523

Role of Glycosyltransferases Modifying Type B Flagellin of Emerging Hypervirulent Clostridium difficile Lineages and Their Impact on Motility and Biofilm Formation

2016· article· en· W2529555756 sur OpenAlexaff
Esmeralda Valiente, Laura Bouché, Paul G. Hitchen, Alexandra Faulds‐Pain, Mário Songane, Lisa F. Dawson, Elizabeth Donahue, Richard A. Stabler, Maria Panico, Howard R. Morris, Mona Bajaj‐Elliott, Susan M. Logan, Anne Dell, Brendan W. Wren

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesWellcome TrustWellcome
Mots-clésFlagellinGlycosyltransferaseGlycanClostridium difficileMicrobiologyBiofilmBiologyClostridium difficile toxin AMotilityGlycosylationPathogenChemistryBiochemistryGeneCell biologyBacteriaGlycoproteinGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clostridium difficile is the principal cause of nosocomial infectious diarrhea worldwide. The pathogen modifies its flagellin with either a type A or type B O-linked glycosylation system, which has a contributory role in pathogenesis. We study the functional role of glycosyltransferases modifying type B flagellin in the 023 and 027 hypervirulent C. difficile lineages by mutagenesis of five putative glycosyltransferases and biosynthetic genes. We reveal their roles in the biosynthesis of the flagellin glycan chain and demonstrate that flagellar post-translational modification affects motility and adhesion-related bacterial properties of these strains. We show that the glycosyltransferases 1 and 2 (GT1 and GT2) are responsible for the sequential addition of a GlcNAc and two rhamnoses, respectively, and that GT3 is associated with the incorporation of a novel sulfonated peptidyl-amido sugar moiety whose structure is reported in our accompanying paper (Bouché, L., Panico, M., Hitchen, P., Binet, D., Sastre, F., Faulds-Pain, A., Valiente, E., Vinogradov, E., Aubry, A., Fulton, K., Twine, S., Logan, S. M., Wren, B. W., Dell, A., and Morris, H. R. (2016) J. Biol. Chem. 291, 25439-25449). GT2 is also responsible for methylation of the rhamnoses. Whereas type B modification is not required for flagellar assembly, some mutations that result in truncation or abolition of the glycan reduce bacterial motility and promote autoaggregation and biofilm formation. The complete lack of flagellin modification also significantly reduces adhesion of C. difficile to Caco-2 intestinal epithelial cells but does not affect activation of human TLR5. Our study advances our understanding of the genes involved in flagellar glycosylation and their biological roles in emerging hypervirulent C. difficile strains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,348

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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