MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2530478067 · doi:10.25560/7016

The Role of the Early Secretory Pathway in Foot-and-Mouth Disease Virus Replication

2011· dissertation· en· W2530478067 sur OpenAlexfundno aff
Rebecca J. Midgley

Notice bibliographique

RevueSpiral (Imperial College London) · 2011
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Disease Management and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthUniversity of TorontoUniversity of BristolMcGill University
Mots-clésReplication (statistics)Foot-and-mouth disease virusVirologyDiseaseBiologyMedicineVirusInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Foot-and-Mouth Disease Virus (FMDV) induces rearrangements of host-cell membranes to generate vesicles that are believed to provide platforms for formation of the viral replication complex. The cellular origin of these vesicles and the properties that make them favourable for replication are poorly understood. For some Picornaviruses these vesicles are thought to derive from membranes of the secretory pathway. In this thesis, I have investigated a role for membranes of the secretory pathway in FMDV infection. Key cellular proteins involved in regulating the flow of membranes through the secretory pathway between the ER and Golgi were inhibited using expression of dominant-negative (dn) proteins and small interfering RNA (siRNA) and the effect on FMDV infection determined. Inhibition of ER export using a drug (H89) or Sar1 (the GTPase required for COPII transport vesicle formation at ER exit sites) reduced FMDV infection. In contrast, stabilisation of COPII coats, or inhibition of Arf1 or Rab proteins, that are involved in the secretory pathway after the formation of COPII vesicles, had little or no inhibitory effect on infection. Interestingly inhibition of Arf1, Rab1 or Rab2 enhanced infection. In contrast, Arf1 reduced infection by bovine enterovirus which is inhibited by Brefeldin-A, and therefore likely to be dependent on Arf1 for replication. These results show that Sar1 and/or COPII vesicle formation is necessary for FMDV infection and that inhibiting the formation of COPI coats is in some way advantageous to FMDV infection. These results suggest that FMDV targets COPII vesicles membranes before the COPII/COPI exchange and facilitates FMDV infection and that COPI components are not required.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,794
Score d'incertitude au seuil0,541

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueSpiral (Imperial College London)Même sujetAnimal Disease Management and EpidemiologyTravaux en français237 207