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Enregistrement W2530762184 · doi:10.1111/ejh.12819

Novel G6B gene variant causes familial autosomal recessive thrombocytopenia and anemia

2016· article· en· W2530762184 sur OpenAlexaff
Motasem Melhem, Mohamed Abu‐Farha, Dinu Antony, Ashraf Al Madhoun, Chiara Bacchelli, Fadi Alkayal, Irina Al‐Khairi, Sumi Elsa John, Mohamad Alomari, Phillip Beales, Osama Alsmadi

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal Of Haematology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePlatelet Disorders and Treatments
Établissements canadiensWindsor Regional Hospital
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDasman Diabetes InstituteKuwait Foundation for the Advancement of SciencesNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésBiologyExome sequencingGeneticsHaploinsufficiencyGeneMutationPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objective To characterize the underlying genetic and molecular defects in a consanguineous family with lifelong blood disorder manifested with thrombocytopenia (low platelets count) and anemia. Methods Genetic linkage analysis, exome sequencing, and functional genomics were carried out to identify and characterize the defective gene. Results We identified a novel truncation mutation (p.C108*) in chromosome 6 open reading frame 25 ( C6orf25 ) gene in this family. We also showed the p.C108* mutation was responsible for destabilizing the encoded truncated G6B protein. Unlike the truncated form, wild‐type G6B expression resulted in enhanced K562 differentiation into megakaryocytes and erythrocytes. C6orf25, also known as G6B , is an effector protein for the key hematopoiesis regulators, Src homology region 2 domain‐containing phosphatases SHP ‐1 and SHP ‐2. Conclusion G6B seems to act through an autosomal recessive mode of disease transmission in this family and regarded as the gene responsible for the observed hematological disorder. This inference is well supported further by in vivo evidence where similar outcomes were reported from G6b −/− and SHP 1/2 DKO mouse models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,338
Score d'incertitude au seuil0,363

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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