Analysis of <i>Coxiela burnetti</i> dihydrofolate reductase via <i>in silico</i> docking with inhibitors and molecular dynamics simulation
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Coxiella burnetii is a gram-negative bacterium able to infect several eukaryotic cells, mainly monocytes and macrophages. It is found widely in nature with ticks, birds, and mammals as major hosts. C. burnetii is also the biological warfare agent that causes Q fever, a disease that has no vaccine or proven chemotherapy available. Considering the current geopolitical context, this fact reinforces the need for discovering new treatments and molecular targets for drug design against C. burnetii. Among the main molecular targets against bacterial diseases reported, the enzyme dihydrofolate reductase (DHFR) has been investigated for several infectious diseases. In the present work, we applied molecular modeling techniques to evaluate the interactions of known DHFR inhibitors in the active sites of human and C. burnetii DHFR (HssDHFR and CbDHFR) in order to investigate their potential as selective inhibitors of CbDHFR. Results showed that most of the ligands studied compete for the binding site of the substrate more effectively than the reference drug trimethoprim. Also the most promising compounds were proposed as leads for the drug design of potential CbDHFR inhibitors.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle