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Enregistrement W2531150725 · doi:10.1093/ofid/ofw172.1844

A Prospective Observational Study to Evaluate a Cytomegalovirus(CMV)–specific T-SPOT® Assay in Hematopoietic Stem Cell Transplant Recipients: The REACT Study Interim Data Review

2016· article· en· W2531150725 sur OpenAlexaff
Ella Ariza‐Heredia, Dimpy P. Shah, Firas El Chaer, Kathleen M. Mullane, Scott D. Rowley, Pranatharthi Chandrasekar, Drew J. Winston, Parameswaran Hari, Heather L. Gillis, Rajneesh Nath, Deepali Kumar, Sherif B. Mossad, Per Ljungman, Roy F. Chemaly

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInterimCytomegalovirusObservational studyHematopoietic stem cell transplantationStem cellCytomegalovirus infectionsVirologyImmunologyInternal medicineTransplantationHuman immunodeficiency virus (HIV)VirusHerpesviridaeViral diseaseHuman cytomegalovirusBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. Cytomegalovirus (CMV) infection causes significant morbidity and mortality after allogeneic hematopoietic cell transplantation (allo-HCT). CMV management after HCT includes risk stratification and mainly a preemptive strategy with CMV viral load serial monitoring. Cell mediated immunity (CMI) plays a role in CMV reactivation and can be assessed by cytokine responses such as T cell production of interferon gamma (IFN-γ). Quantification of CMV CMI may have value in CMV management. This study evaluated the potential of a CMV-specific ELISPOT assay to determine CMI against CMV reactivation in allo-HCT recipients ≤26 weeks post-HCT. Methods. This is an ongoing, multi-center, prospective, observational study of ≥150 adult CMV seropositive allo-HCT recipients. CMV management was according to institutional protocols. Date of CMV reactivation, as defined by each institution, was recorded. T cell responses were serially monitored pre-, and every 2 weeks post-transplantation up to 26 weeks with an ELISPOT assay that uses CMV-specific antigens IE-1 and pp65 (T-SPOT.CMV, Oxford Diagnostics Laboratories®, Memphis, TN). Data reviewed include patients reaching ≥12 weeks post-HCT by March 2016. Results. Thirty-five patients across 6 sites reached ≥12 weeks post-HCT, and 15 reached ≥22 weeks. Majority of the patients were white (54%), males (77%), with a median age of 57 (25–80) years, and had unrelated (43%) or matched related (46%) HCT. CMV reactivation occurred in 13 patients (37%) and time to first reactivation occurred ≤10 weeks post-HCT (figure 1). Average immune response as measured by CMV-specific IE-1 and pp65 spot counts (SPC) increased over time post-transplantation (Figure 2). Conclusion. The preliminary analysis of the REACT study showed CMV reactivation occurred early during transplantation when the CMV immune response (measured by a CMV-specific ELISPOT assay) was lower. In contrast, no reactivation was seen later on when immune response was higher. This study may provide insights into the CMV immune response which may guide personalized decisions regarding CMV management. Disclosures. E. Ariza-Heredia, Oxford Immunotec: Investigator, Research support; K. Mullane, Oxford Immunotec: Investigator, Research support; S. Rowley, Oxford Immunotec: Investigator, Research support; P. Chandrasekar, Oxford Immunotec: Investigator, Research support; D. J. Winston, Oxford Immunotec: Investigator, Research support; P. Hari, Oxford Immunotec: Investigator, Research support; H. Gillis, Oxford Immunotec: Employee, Salary; R. Nath, Oxford Immunotec: Investigator, Research support; D. Kumar, Oxford Immunotec: Investigator, Research support; S. Mossad, Oxford Immunotec: Investigator, Research support; P. Ljungman, Oxford Immunotec: Consultant and Investigator, Consulting fee and Research support; R. F. Chemaly, Oxford Immunotec: Consultant, Grant Investigator and Investigator, Consulting fee, Research support and Speaker honorarium

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,051

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,137
Tête enseignante GPT0,402
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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