Integrated multi-omics of the human gut microbiome in a case study of familial type 1 diabetes
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.
Scores machine (provisoires)
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
- Écart entre enseignants
- 0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
- Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline· tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle
Résumé
The gastrointestinal microbiome is a complex ecosystem with functions that shape human health. Studying the relationship between taxonomic alterations and functional repercussions linked to disease remains challenging. Here, we present an integrative approach to resolve the taxonomic and functional attributes of gastrointestinal microbiota at the metagenomic, metatranscriptomic and metaproteomic levels. We apply our methods to samples from four families with multiple cases of type 1 diabetes mellitus (T1DM). Analysis of intra- and inter-individual variation demonstrates that family membership has a pronounced effect on the structural and functional composition of the gastrointestinal microbiome. In the context of T1DM, consistent taxonomic differences were absent across families, but certain human exocrine pancreatic proteins were found at lower levels. The associated microbial functional signatures were linked to metabolic traits in distinct taxa. The methodologies and results provide a foundation for future large-scale integrated multi-omic analyses of the gastrointestinal microbiome in the context of host-microbe interactions in human health and disease.
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La notice
- Revue
- Nature Microbiology
- Thématique
- Gut microbiota and health
- Domaine
- Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
- Établissements canadiens
- —
- Organismes subventionnaires
- Fonds National de la Recherche LuxembourgInternational Council for Canadian StudiesEU Joint Programme – Neurodegenerative Disease ResearchIntegrated BioBank of LuxembourgUniversité du Luxembourg
- Mots-clés
- MicrobiomeMetagenomicsBiologyContext (archaeology)Gut microbiomeMetaproteomicsHuman microbiomeComputational biologyDiseaseType 2 diabetesBioinformaticsEvolutionary biologyGeneticsDiabetes mellitusGeneMedicineInternal medicineEndocrinology
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui