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Enregistrement W2532488083 · doi:10.1017/cjn.2016.343

OS13 - 175 Genetic Profiling of Radiation Induced Meningiomas

2016· article· en· W2532488083 sur OpenAlexaffvenue
Pete Tonge, Sameer Agnihotri, Shahrzad Jalali, KD Aldape, Gelareh Zadeh

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMeningioma and schwannoma management
Établissements canadiensUniversity of AlbertaPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMeningiomaBiologyComparative genomic hybridizationExome sequencingDNA methylationExomeGeneticsMethylationCopy-number variationCancer researchGeneChromosomeGenomePathologyMedicineMutationGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One-third of all primary central nervous system tumors in adults are meningiomas, which arise from the meninges. Although the majority of meningioma cases are not associated with an environmental risk factor, it is well established that individuals receiving radiation treatment to the CNS are susceptible to radiation-induced meningiomas (RIMs). The genomic integrity of spontaneous meningiomas has been extensively profiled by whole genome sequencing and exome sequencing, providing a well-developed catalogue of meningioma associated mutations. In contrast, a comprehensive understanding of the molecular changes associated with RIMs is not available. Comparative genomic hybridization (CGH) has previously revealed that >90% of RIMs possess multiple regions of DNA copy number alterations, with the most common chromosomal loss being chromosome 1p and 22q. These CGH based studies of gross chromosomal alterations suggest that radiation induced meningiomas show no significant differences to spontaneous meningiomas. We have extensively characterized RIMs through the profiling of their global CpG methylation, gene expression and mutation signatures. The integration of these three platforms at base-pair resolution methylation has facilitated the identification of molecular changes that contribute to RIM. This is the largest cohort of profiled meningiomas to date, providing a robust characterization of unique RIM features that can be exploited for future therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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