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Enregistrement W2534654788 · doi:10.1016/j.jalz.2016.06.1265

P2‐060: A Harmonized Protocol for Medial Temporal Lobe Subfield Segmentation: Initial Results of The 3‐Tesla Protocol For The Hippocampal Body

2016· article· en· W2534654788 sur OpenAlexaff
Laura E.M. Wisse, Ana M. Daugherty, Robert Amaral, David Berron, Valerie A. Carr, Arne D. Ekstrom, Prabesh Kanel, Geoffrey A. Kerchner, Susanne Mueller, John Pluta, Craig E.L. Stark, Trevor A. Steve, Lei Wang, Michael A. Yassa, Paul A. Yushkevich, Renaud La Joie

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBrain Tumor Detection and Classification
Établissements canadiensUniversity of AlbertaMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHippocampal formationWhite matterSegmentationTemporal lobeDiffusion MRILobeAnatomyNeuroscienceMagnetic resonance imagingPsychologyMedicineComputer scienceArtificial intelligenceRadiologyEpilepsy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alzheimer’s disease (AD), aging and vascular pathology are proposed to differentially affect subregions of the medial temporal lobe (MTL). Characterizing these differences may provide more insight in disease processes and better biomarkers. However, the comparison of different studies is hampered by differences in how these subfields are segmented on in vivo MRIs by different research groups. The Hippocampal Subfields Group (HSG) was formed to create a harmonized protocol for MTL subregion segmentation. The group began developing a subfield segmentation protocol for the hippocampal body using high-resolution T2-weighted 3 tesla MRI. We present the initial results of this effort. Stage 1. Establish the anterior and posterior borders of the hippocampal body as a whole and the boundaries with surrounding structures, 2. Determine subfield boundaries on histological sections throughout the hippocampal body in three specimens, 3. Identify the corresponding boundaries between adjacent subfields on in vivo MRI, 4. Solicit feedback on the initial protocol from the HSG, and 5. Perform formal reliability analysis by six experts. The initial results are from stage 1. The anterior border was defined as one slice posterior to the last slice containing the uncal apex and the posterior border as the most posterior slice containing the colliculi. A reliability test yielded a Fleiss κ >0.75. An initial protocol for the boundaries with surrounding structures is also developed, with the dorsal and lateral border at the interface of the gray matter of the hippocampus and the white matter of the alveus/fimbria, the ventral border placed at the parahippocampal white matter and the medial border at the most medial point of the hippocampus. Additionally, the histological annotations are being finalized and an MRI protocol for the subfield boundaries is being prepared. The harmonized protocol, once completed, is expected to impact the field significantly by producing measurements that are comparable between labs and by making it easier to relate and pool results from different studies. Given the heterogeneity of AD, vascular and aging-related changes in the MTL, a reliable measure of subfield-specific effects may lead to more powerful biomarkers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,289
Score d'incertitude au seuil0,423

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,121
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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