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Enregistrement W2535239418 · doi:10.1182/blood.v112.11.1868.1868

Increased Nucleosomal DNA Fragmentation in Leukocytes of Thalassemia Patients.

2008· article· en· W2535239418 sur OpenAlexaff
Patrick B. Walter, John B. Porter, Patricia Evans, Janet Kwiatkowski, Ellis J. Neufeld, Thomas D. Coates, Patricia J. Giardina, Robert jW Grady, Elliott Vichinsky, Nancy F. Olivieri, Felicia Trachtenberg, Daniele Alberti, Ellen B. Fung, Bruce N. Ames, Annie Lui, Paul Harmatz

Notice bibliographique

RevueBlood · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemoglobinopathies and Related Disorders
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA fragmentationApoptosisDeferasiroxFragmentation (computing)ThalassemiaMedicineImmunologyMolecular biologyInternal medicineBiologyBiochemistryProgrammed cell death

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Iron overload has been shown to induce DNA damage and may be implicated in leukocyte apoptosis. Previously we have shown that indirect markers of apoptosis such as caspase activity and Bax levels were higher in leukocytes of thalassemia patients. We have now assessed whether nucleosomal DNA fragmentation, a hallmark of apoptosis, is higher in leukocytes of iron-overloaded thalassemia patients compared with control subjects. Methods: Thalassemia Clinical Research Network patients participating in the Novartis CICL670A0107 trial (a randomized comparison of deferasirox, an oral iron chelator, vs. DFO) were eligible and 44 (25 male, mean age: 21.8 ± 11.1 yrs) were enrolled in the study. Fasting blood samples were obtained after a 5-day washout of DFO prior to commencing treatment with study drug, and 24 hours post-chelator at 1, 6, and 12 months on study. Thirty healthy controls matched for age, sex, race and antioxidant usage (15 male, mean age 24.5 ± 9 yrs) also supplied a blood sample. Plasma, serum and cells were separated by centrifugation. The classic marker for apoptosis, nucleosomal DNA fragmentation was determined by a high throughput ELISA assay that used monoclonal antibodies directed against single- and double-stranded DNA bound to histones (H1, H2A, H2B, H3, and H4) and thus specifically detected mono- and oligonucleosomes (measured in ng/μg leukocyte protein). Detection of free mono- or oligonucleosomes is a direct measurement of apoptotic DNA fragmentation. DNA fragmentation results were log-transformed prior to analysis and means are reported. Results: At baseline, thalassemia patients had elevated nucelosomes compared to the controls (351.5 vs. 74.9 ng/μg leukocyte protein, p = 0.001). This high level of leukocyte DNA fragmentation was unchanged throughout the study. Furthermore, nucleosomal DNA fragmentation was positively correlated with CRP (r = 0.3, p = 0.01), WBC (r = 0.2, p = 0.05) and ANC (r = 0.2, p = 0.04), suggesting apoptosis is present in increased inflammatory states. Conclusions: This finding demonstrates that nucleosomal DNA fragmentation is higher in thalassemia compared to control patients and thus provides further evidence that there is increased apoptosis in circulating leukocytes of thalassemia patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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