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Enregistrement W2535264792 · doi:10.1016/j.jalz.2016.06.1817

P3‐157: Indices of Plasmalogen Biosynthesis in ADNI‐1 Baseline Serum Samples: Association with Progression to Dementia in Subjects with Mild Cognitive Impairment

2016· article· en· W2535264792 sur OpenAlexaff
Mitchel A. Kling, Dayan B. Goodenowe, Jon B. Toledo, Vijitha Senanayake, Rebecca Baillie, Joseph E. Lucas, Jessica D. Tenenbaum, Alison A. Motsinger‐Reif, Xianlin Han, Rima Kaddurah‐Daouk

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePeroxisome Proliferator-Activated Receptors
Établissements canadiensPhenomenome Discoveries (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlasmalogenPeroxisomeInternal medicineBiosynthesisBiochemistryAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNeuroprotectionEndocrinologyAlzheimer's diseaseBiologyChemistryMedicineDiseaseEnzymePhospholipidMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Altered lipid metabolism has been implicated epidemiologically in risk for sporadic Alzheimer’s disease (AD); the underlying mechanisms remain uncertain. Although cholesterol and circulating lipoproteins have been the most well-studied lipids in AD, recent data implicate other classes such as glycerophospholipids (GPL). Plasmalogens (Pls), a GPL subclass, are integral membrane components with functions relevant to AD pathophysiology, including promoting vesicle fusion necessary for synaptic neurotransmitter release; modulation of membrane fluidity, raft dynamics, and antioxidant functions; and neuroprotection. Plasmalogen-rich membrane regions favor amyloid precursor protein (APP) breakdown by α-secretase to non-amyloidogenic products, over amyloidogenic β-secretase-mediated products that promote AD plaque formation. The initial steps of endogenous Pls synthesis require peroxisomes, notably in the liver. Peroxisomal function is decreased in older individuals; previous studies have shown decreased Pls in AD serum and postmortem brain. We measured Pls biosynthesis indices in ADNI-1 baseline serum vs. progression from MCI to AD. We measured 4 ethanolamine plasmalogens (PlsEtn) and 4 related phosphatidylethanolamines (PtdEtn) by flow-injection tandem mass spectrometry (FIA-MS/MS) in serum from 736 Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI-1) subjects that included 20 blinded technical replicates. We calculated 5 key ratios of PlsEtn species to each other and to corresponding PtdEtn reflecting Pls biosynthesis and peroxisomal beta-oxidation. Quality control analyses showed strong correlation between replicates (r>0.95, p<0.001) for all ratios. We then calculated an index of plasmalogen biosynthesis from the mean of 2 ratios (PlsEtn 22:6/PtdEtn 22:6, PlsEtn 20:5/PtdEtn 22:6), termed “PL/PE.” We examined the relationship between the PL/PE ratio and progression to AD in 358 patients with MCI at baseline, adjusting for age, gender, APOE genotype, body mass index, and concomitant medications. Higher baseline PL/PE was associated with a significantly (HR = 0.80, p<0.01) reduced risk of progression to AD in patients with MCI at baseline (Figure).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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