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Enregistrement W2535335423 · doi:10.1074/jbc.m116.756544

Regulation of TRPP3 Channel Function by N-terminal Domain Palmitoylation and Phosphorylation

2016· article· en· W2535335423 sur OpenAlexafffund
Wang Zheng, Jungwoo Yang, Erwan Beauchamp, Ruiqi Cai, Shaimaa Hussein, Laura Hofmann, Qiang Li, Veit Flockerzi, Luc G. Berthiaume, Jingfeng Tang, Xing‐Zhen Chen

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAlberta InnovatesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPalmitoylationXenopusPhosphorylationBiologyCell biologyHEK 293 cellsMutantPhosphataseBiochemistryMolecular biologyReceptorCysteineEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transient receptor potential polycystin-3 (TRPP3) is a cation channel activated by calcium and proton and is involved in hedgehog signaling, intestinal development, and sour tasting. How TRPP3 channel function is regulated remains poorly understood. By N-terminal truncation mutations, electrophysiology, and Xenopus oocyte expression, we first identified fragment Asp-21-Ser-42 to be functionally important. We then found that deletion mutant Δ1-36 (TRPP3 missing fragment Met-1-Arg-36) has a similar function as wild-type TRPP3, whereas Δ1-38 is functionally dead, suggesting the importance of Val-37 or Cys-38. Further studies found that Cys-38, but not Val-37, is functionally critical. Cys-38 is a predicted site of palmitoylation, and indeed TRPP3 channel activity was inhibited by palmitoylation inhibitor 2-bromopalmitate and rescued by palmitoylation substrate palmitic acid. The TRPP3 N terminus (TRPP3NT, Met-1-Leu-95) localized along the plasma membrane of HEK293 cells but stayed in the cytoplasm with 2-bromopalmitate treatment or C38A mutation, indicating that TRPP3NT anchors to the surface membrane through palmitoylation at Cys-38. By acyl-biotin exchange assays, we showed that TRPP3, but not mutant C38A, is indeed palmitoylated. When putative phosphorylation sites near Cys-38 were mutated to Asp or Glu to mimic phosphorylation, only T39D and T39E reduced TRPP3 function. Furthermore, TRPP3NT displayed double bands in which the upper band was abolished by λ phosphatase treatment or T39A mutation. However, palmitoylation at Cys-38 and phosphorylation at Thr-39 independently regulated TRPP3 channel function, in contrast to previous reports about correlated palmitoylation with a proximate phosphorylation. Palmitoylation at Cys-38 represents a novel mechanism of functional regulation for TRPP3.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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