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Enregistrement W2536180998 · doi:10.1212/wnl.86.16_supplement.p5.166

Role of INPP5D, PTK2B, ZCWPW1 and TREM 2 in Predicting Risk of Progression in Cognitively Impaired Subjects to Alzheimer's Disease (P5.166)

2016· article· en· W2536180998 sur OpenAlexaffabout
Connor Hawkins, Alice Fok, Howard Feldman, A. Dessa Sadovnick, Ging‐Yuek Robin Hsiung

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGDF15 and Related Biomarkers
Établissements canadiensUniversity of British Columbia HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiseaseMedicineAlzheimer's diseaseNeurosciencePsychologyAudiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: To examine the correlation between four risk loci and clinical progression to Alzheimer's Disease. Background: Recent genome-wide association studies have identified several new genetic risk loci for Alzheimer's Disease (AD), including INPP5D (rs35349669), PTK2B (rs28834970), ZCWPW1 (rs1476679) and TREM2 (rs75932628). Their utility in predicting outcome of patients with cognitive impairment has not been examined. We used two large Canadian cohorts to study the role of these genes in predicting the outcome of patients with cognitive impairment. Methods: In the current analysis, we compared genotype frequency in cognitively stable patients diagnosed as not cognitively impaired (NCI) or cognitively impaired no dementia (CIND) but never declined over the duration of study, to those who progressed to AD. Single nucleotide polymorphisms genotypes for INPP5D, PTK2B, ZCWPW1 and TREM 2 were obtained using TaqMan assays. Genotype frequencies were examined with chi-square tests, and odds ratios were calculated by multivariate logistic regression with age, sex, education, and APOE e4 status as covariates. Results: Within the 2 cohorts, 401 subjects who remained cognitively normal until at the end of the cohort study were used as controls, while 348 diagnosed with AD were cases. Of the 4 SNPs examined in this study, only PTK2B was significant (p=0.042). When we compared the genotypic frequencies between subjects with CIND who remained stable vs. those who progressed to AD (n=134), the significance is even stronger (p<0.001), with an O.R. of 1.75 (95[percnt] C.I 1.13-2.71), which remains constant after adjustment with age, sex, and APOE e4 carrier status. Conclusions: We found that only the PTK2B risk allele was significantly associated with progression from cognitive impairment, which is independent from the effect of age and APOE genotype. These findings contribute to our understanding of the pathogenesis of AD, which may help develop potential novel biomarkers and therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil0,313

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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