Abstract A18: Investigating the differential expressions of miRNAs and programmed-death-ligand-1 related to the T-bet positive tumor-infiltrating lymphocytes in axillary-node-negative breast cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Axillary lymph node-negative (ANN) breast cancer (BC) patients generally have a good prognosis; however, 20-30% of ANN patients will experience recurrence. To identify biomarkers that distinguish ANN patients who may benefit from systemic therapy we have been studying characteristics of the breast tumor cells and the tumor microenvironment. We have found that tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) that express T-bet (T-box transcription factor) are associated with poor prognosis features such as high grade, hormone receptor negativity and basal subtype. Despite these adverse clinical-pathologic characteristics, T-bet+ TILs cells are associated with a favorable outcome. T-bet is essential for Th1 development and IFN-γ production. To investigate how T-bet+ TILs influence the BC suppression, we are examining molecular differences in T-bet+/high and T-bet-/low tumors including expression of tumor miRNA expression profiles and expression of Programmed-Death-Ligand-1 (PD-L1). Tumors expressing PD-L1 inhibit Programmed-Death-receptor-1-(PD-1)-expressing TILs and evade immune surveillance. Interestingly, PD-L1 is induced by IFNγ, the hallmark cytokine of the T-bet+ TILs, which suggests a potential relationship between the tumor PD-L1 and T-bet+ TILs. Microdissected, formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) samples of 35 T-bet+/high and 35 T-bet-/low ANN BC tumors are being used to identify the differentially-expressed miRNAs via miRNA sequencing. The sufficiency of the FFPE samples as the miRNA source was confirmed by quantifying miRNA expressions in the 3-5 paired frozen and FFPE samples, and observing the expressions to be highly correlated with both qPCR (r=0.81) and miRNA sequencing (rs=0.73). After identifying the differentially-expressed miRNAs via miRNA sequencing, these miRNAs will be validated via qPCR in both the original and independent BC tumor set. Based on the genes and molecular pathways the validated miRNA(s) may regulate, appropriate in vitro functional assays will be conducted to examine their roles in cellular proliferation, migration and invasion. Furthermore, PD-L1 mRNA expression has been evaluated in 107 ANN tumors and correlations with clinico-pathological characteristics will be determined. Identifying the tumor miRNA(s) associated with T-bet+ TILs and studying their functions may indicate differences between T-bet+/high and T-bet-/low tumors that can be used to improve the prognosis of ANN BC. Characterizing the tumor PD-L1 expression based on T-bet+ TILs and the clinical data may distinguish a subset of ANN BC patients who may benefit from the PD-L1 blockade therapy. Citation Format: Minji Lee, Anna-Marie Mulligan, Shelley Bull, Dushanti Pinnaduwage, Irene Andrulis. Investigating the differential expressions of miRNAs and programmed-death-ligand-1 related to the T-bet positive tumor-infiltrating lymphocytes in axillary-node-negative breast cancer. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference: Function of Tumor Microenvironment in Cancer Progression; 2016 Jan 7–10; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2016;76(15 Suppl):Abstract nr A18.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».