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Enregistrement W2536782291

Protein-Protein interactions between startch synthetic enzymes in cereals

2010· dissertation· en· W2536782291 sur OpenAlexfundno aff
Fushan Liu

Notice bibliographique

RevueThe Atrium (University of Guelph) · 2010
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaCommonwealth Scientific and Industrial Research OrganisationIowa State University
Mots-clésEnzymeBiochemistryChemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Starch is widely used in food and non-food sectors.Its biosynthesis is known to involve at least four groups of committed enzymes: ADP-glucose pyrophosphorylase, starch synthases (SS), starch branching enzymes (SBE), and debranching enzymes (DBE).Plastidial starch phosphorylase (SP) is also suggested to be involved in starch biosynthesis.Significant proportions of the starch biosynthetic enzymes, particularly SSI, SSIIa, and SBEIIb are bound to starch granules in maize.In this thesis, biochemical studies on protein-protein interactions between key enzymes of the starch biosynthetic pathway in wheat and maize endosperms, identify a potentially important mechanism of regulating starch biosynthesis by formation of phosphorylation-dependent multi-enzyme complexes between isoforms of starch synthases and branching enzymes.Furthermore, studies on a well-characterized maize mutant lacking the dominant branching enzyme activity, SBEIIb, amylose extender (ae -), demonstrated distinct patterns of protein-protein interactions compared with wild-type, suggesting functional complementation for the loss of SBEIIb in protein complexes by SBEI, SBEIIa and SP.Co-immunoprecipitation using peptide-specific antibodies showed that in amyloplasts from normal maize endosperm, protein-protein interactions involving SSI, SSIIa, and SBEIIb could be detected.By contrast, in ae -amyloplasts, SSI and SSIIa were shown to interact with SBEI, SBEIIa and SP.All interactions in normal maize were strongly enhanced by ATP, and reduced by the addition of alkaline phosphatase, indicating a role for protein phosphorylation in assembly.All the protein-protein interactions observed in wildtype and the ae -mutant occur during the grain-filling stage of endosperm development.Interactions were also reconstituted in vitro using recombinant forms of SSs and SBEs.This study proposes that during amylopectin biosynthesis in maize amyloplasts, SSI and SSIIa form the core of a phosphorylation-dependent glucan-synthesizing protein complex which, in wildtype endosperm, recruits SBEIIb, but when SBEIIb is absent (ae -), recruits SBEI, SBEIIa and SP.These differences in protein complexes are mirrored in the complement of starch synthesizing enzymes detected in starch granules of each genotype, reinforcing the hypothesis that the complexes play a functional role in starch biosynthesis.i

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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