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Enregistrement W2537457916 · doi:10.1016/j.jalz.2016.06.822

P1‐074: Designing Small Molecules as Pharmacological Tools to Study Alzheimer's Disease

2016· article· en· W2537457916 sur OpenAlexaff
Praveen P. N. Rao

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholinesterase and Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSmall moleculeChemistryDrug discoveryHyperphosphorylationTau proteinAmyloid betaAmyloid (mycology)BiophysicsNeuroscienceDiseaseAlzheimer's diseaseBiochemistryBiologyMedicinePhosphorylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alzheimer’s disease (AD) is a complex neurodegenerative disorder characterized by loss of memory, cognition and dementia. The pathophysiology of AD is complex and is not clearly understood. Some major hypotheses of AD include the cholinergic dysfunction, amyloid cascade, tau hyperphosphorylation and oxidative stress. In this regard, we are developing small molecules as chemical and pharmacological tools to study the mechanisms of the amyloid cascade hypothesis of AD. The ultimate goal is to develop small molecules as potential disease modifying agents with ability to target multiple pathways associated with AD pathophysiology as opposed to the traditional “one drug, one target” approach. Small molecules were designed using computational chemistry tools. Compound libraries were synthesized and evaluated using biochemical/biophysical techniques including Aβ40/42 aggregation kinetics and transmission electron microscopy (TEM). Computational studies were conducted to understand the forces involved in ligand-protein aggregate binding interactions. A large library of small molecules with diverse chemical features and core ring scaffolds were synthesized. The biological assay screening studies have identified a number of monocyclic, bicyclic and tricyclic rings that exhibit Aβ-aggregation inhibition as confirmed by aggregation kinetics assay and TEM studies. Computational studies suggest that the binding of these small molecules to Aβ-aggregates including dimers, oligomers and fibrils can stabilize the complex and prevent further aggregation and their accumulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,098
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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