Molecular Epidemiological study of Campylobacter spp. Carriage in Mammalian Wildlife and Livestock on Southern Ontario
Notice bibliographique
Résumé
This thesis is focuses on Campylobacter carriage in mammalian wildlife and livestock in southern Ontario. Multi-level logistic regression models were constructed to investigate Campylobacter spp. and antimicrobial resistant Campylobacter spp. carriage in wildlife and livestock species on 25 farms. Samples were collected from dairy and beef cattle, swine and raccoons as well as a selection of other mammalian wildlife. Molecular subtyping data, produced by the Campylobacter–specific 40-gene comparative genomic fingerprinting assay (CGF40), were used to compare isolates from wildlife and livestock. Cluster analysis was conducted to visualize the groupings of wildlife and livestock C. jejuni isolates found. Wildlife and livestock carried Campylobacter at significantly different prevalences, had different antibiograms, and rarely shared the same CGF40 subtypes. Dendrogram and correspondence analysis indicated that the subtypes of Campylobacter circulating in livestock and wildlife populations were distinct. Combined, these results suggest that transmission between mammalian wildlife, especially raccoons, and livestock is limited.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».