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Enregistrement W2537879552 · doi:10.1093/eurheartj/ehw457

Close connections between contraction and rhythm: a new genetic cause of atrial fibrillation/cardiomyopathy and what it can teach us

2016· letter· en· W2537879552 sur OpenAlexafffund
Stanley Nattel

Notice bibliographique

RevueEuropean Heart Journal · 2016
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAtrial Fibrillation Management and Outcomes
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill UniversityMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésFrameshift mutationMedicineGeneticsAtrial fibrillationMolecular geneticsGeneBioinformaticsCardiologyBiologyMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This editorial refers to ‘A frameshift deletion in the sarcomere gene MYL4 causes early-onset familial atrial fibrillation’†, by D.F. Gudbjartsson et al. , on page 27. A review of the literature published a decade ago reported that almost nothing was known about the genetics of atrial fibrillation (AF), but suggested that ‘Identifying the gene of susceptibility, coupled with defining the sequence and function of the protein that it encodes, has the potential to provide both insight into the pathophysiology of the arrhythmia and diagnostic tools with which to identify susceptible individuals’.1 Subsequent work has richly confirmed the validity of this statement. A recent review listed 33 rare variants and 14 genetic loci associated with AF, and discussed the importance of their discovery for pathophysiological understanding and clinical practice.2 Of the rare variants, the most common motifs are variants in ion-channel subunits (in 21) and transcription factors (in 6). AF clearly has a strong heritable basis2 and it is likely that the discovery of novel AF-associated loci will continue to occur and to improve our understanding of this widely prevalent condition. In the present issue of the journal, Gudbjartsson et al. report just such a finding.3 They used highly sophisticated whole-genome sequencing and statistical genetics methods to identify sequence variants linked to early-onset AF in 1799 Icelanders. These approaches revealed a rare frameshift deletion in the atrial myosin light-chain gene MYL4 associating with early-onset AF under recessive inheritance models. Eight homozygous carriers all had early-onset AF, three required pacemakers for sick sinus syndrome, three had strokes (without non-AF risk factors), and one experienced sudden death. ECG intervals were generally unremarkable. The only abnormalities present on early echocardiograms were left atrial dilation in two patients. Late echocardiograms showed …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,684
Score d'incertitude au seuil0,933

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,075
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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