MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2538536654 · doi:10.1177/1747493016672085

Platelet glycoprotein gene Ia C807T, HPA-3, and Ibα VNTR polymorphisms are associated with increased ischemic stroke risk: Evidence from a comprehensive meta-analysis

2016· review· en· W2538536654 sur OpenAlexaboutno aff
Hua Liu, Yi Wang, Jian Zheng, Guangming Li, Tao Chen, Jianguo Lei, Yiting Mao, Jun Wang, Wei Liu, Ge Zhao, Mark Tacey, Bernard Yan

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Stroke · 2016
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntiplatelet Therapy and Cardiovascular Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOdds ratioMeta-analysisMedicineGenotypePublication biasAlleleConfidence intervalGlycoprotein IbInternal medicineGeneticsFunnel plotBioinformaticsStroke (engine)OncologyPlatelet membrane glycoproteinGeneBiologyPlatelet

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background/aims Platelet glycoproteins play a crucial role in the initial stage of thrombus formation and may contribute to the pathophysiology of atherosclerosis. Polymorphisms in glycoprotein genes alter the function of the protein, possibly leading to increased risk of ischemic stroke. However, previous genetic association studies that examined the relationship between glycoprotein genes polymorphisms and ischemic stroke have yielded inconsistent results. This study aimed to evaluate the association between glycoprotein genes and ischemic stroke by the application of meta-analysis. Methods Relevant studies were identified by an extensive search through databases. The quality of included studies was assessed independently using the Newcastle-Ottawa Scale. Allele and genotype frequencies for each included study were extracted. The odds ratio (OR) with 95% confidence interval (95%CI) was calculated using a random-effects or fixed-effects model. Q statistic was used to evaluate homogeneity, and a meta-regression model was used to explore the study-level variables and to describe the heterogeneity in included studies. Egger's test and funnel plot were used to assess publication bias. Results A total of 60 studies (9 polymorphisms) were included and identified in the current meta-analysis. The Newcastle-Ottawa Scale scores ranged from 7 to 9 except for two studies with Newcastle-Ottawa Scale scores of 6. The T allele or TT genotype of the glycoprotein Ia C807T polymorphism were associated with an increased susceptibility to ischemic stroke in combined population (807T allele: OR, 95%CI: 1.24, 1.03-1.50, p = 0.02) or Asian populations (807T allele: OR, 95%CI: 1.31, 1.10-1.54, p = 0.002 and 807TT genotype: OR, 95%CI: 1.53, 1.13-2.08, p = 0.006, respectively), and the Ser allele of HPA-3 was associated with increased risk of ischemic stroke in combined population or in Asians (OR, 95%CI: 1.21, 1.04-1.40, p = 0.01 or 1.54, 1.18-2.01, p = 0.001). Of note, the Ser/Ser genotype was more common in Asians (OR, 95%CI: 2.09, 1.40-3.13, p < 0.001). For glycoprotein Ibα variable number tandem repeat, only B allele showed a mild significant association with ischemic stroke risk in combined population or in Caucasians (OR, 95%CI: 2.17, 1.04-4.55, p = 0.04 or 1.79, 1.02-3.13, p = 0.04). There was no significant association between HPA-1, HPA-2, HPA-4, HPA-5, glycoprotein Ibα-5 T/C as well as Ia G873A polymorphisms and increased risk of ischemic stroke. Conclusions We found that glycoprotein Ia C807T T allele or the TT genotype, the Ser-allele of HPA-3 and B allele of glycoprotein Ibα variable number tandem repeat polymorphisms were associated with increased risk for ischemic stroke. Future studies with larger sample sizes will be necessary to confirm the results. In addition, analyses of ischemic stroke subtypes and gene-gene and gene-environment interactions are warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,143
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,006
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of StrokeMême sujetAntiplatelet Therapy and Cardiovascular DiseasesTravaux en français237 207