Marked Differences in C9orf72 Methylation Status and Isoform Expression between C9/ALS Human Embryonic and Induced Pluripotent Stem Cells
Notice bibliographique
Résumé
We established two human embryonic stem cell (hESC) lines with a GGGGCC expansion in the C9orf72 gene (C9), and compared them with haploidentical and unrelated C9 induced pluripotent stem cells (iPSCs). We found a marked difference in C9 methylation between the cells. hESCs and parental fibroblasts are entirely unmethylated while the iPSCs are hypermethylated. In addition, we show that the expansion alters promoter usage and interferes with the proper splicing of intron 1, eventually leading to the accumulation of repeat-containing mRNA following neural differentiation. These changes are attenuated in C9 iPSCs, presumably owing to hypermethylation. Altogether, this study highlights the importance of neural differentiation in the pathogenesis of disease and points to the potential role of hypermethylation as a neuroprotective mechanism against pathogenic mRNAs, envisaging a milder phenotype in C9 iPSCs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».