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Enregistrement W2538743598 · doi:10.1182/blood.v106.11.3158.3158

Induction of Transient Cytopenia To Analyze Hematopoiesis in Mutant Mice.

2005· article· en· W2538743598 sur OpenAlexaff
William L. Stanford, Nicole Anderson, Mark D. Minden, Dwayne L. Barber

Notice bibliographique

RevueBlood · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBlood disorders and treatments
Établissements canadiensOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésErythropoietin receptorErythropoiesisHaematopoiesisBiologyErythropoietinImmunologyReticulocyteProgenitor cellCell biologyCancer researchAnemiaStem cellGeneticsInternal medicineMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The mouse plays an indispensable role in developing our current understanding of mammalian hematopoiesis. Most hematopoietic phenotyping assays in the mouse are non-viable techniques designed to evaluate homeostatic populations, enumerate progenitor populations, and perform functional analysis. The worldwide effort to generate mouse models of human disease and functionally annotate the mammalian genome using mouse mutagenesis (including dominant ENU screens) requires the development of robust standardized viable phenotyping tools. We have developed a phenotyping assay that induces transient cytopenias using various pharmacological agents (5-fluorouracil, phenylhydrazine, and hydroxyurea), the responses to which are monitored by tracing changes in peripheral blood levels of red blood cells, white blood cells and platelets. We have performed detailed analysis of lineage recovery kinetics, developing lineage recovery curves for various strains of mice for both males and females, which allowed us to identify appropriate testing days to identify phenodeviants. We have compared the recovery data with conventional progenitor assays and analyzed a cohort of well-studied naturally occurring and targeted hematopoietic mutants using the transient anemia assays that has yielded novel phenotypes of hemizygous mutant animals. For example, erythropoietin receptor null embryos die of severe anemia at mid-gestation; however, no defect in erythropoiesis has been reported in EpoR +/− mice. We have found that 5-fluorouracil and phenylhydrazine elicit delayed RBC recovery in EpoR +/− mice, demonstrating a critical dose-dependent role for the erythropoietin receptor in stress erythropoiesis. In addition, Stat5 has been shown to play an important role in erythropoiesis and in the regulation of steady state hematopoiesis. We have found that Stat5a/b+/− mice treated with 5-fluorouracil show altered recovery kinetics in RBC, WBC and platelets. Finally, we have adapted the transient cytopenia assay to develop a sensitized dominant ENU screen, enabling us to identify hematopoietic mutants that do not present abnormal blood cell counts in a homeostatic state. Thus, these standardized cytopenia response assays function as surrogate viable assays to analyze progenitor populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
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