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Enregistrement W2539334125 · doi:10.4238/gmr.15038540

Cloning and characterization of the dehydration-responsive element-binding protein 2A gene in Eruca vesicaria subsp sativa

2016· article· en· W2539334125 sur OpenAlexaff
Binbin Huang, X.K. Zhang, Y.Y. Li, Diyan Li, Mengsi Ma, Di-Xin Cai, Wen-Jun Wu, Beibei Huang

Notice bibliographique

RevueGenetics and Molecular Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics, phytochemicals, and oxidative stress
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesScience and Technology Department of Hubei ProvinceNational Natural Science Foundation of ChinaEuropean Commission
Mots-clésCloning (programming)ErucaDehydrationGeneBiologyBotanyBiochemistryComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Eruca vesicaria subsp sativa is one of the most tolerant Cruciferae species to drought, and dehydration-responsive element-binding protein 2A (DREB2A) is involved in responses to salinity, heat, and particularly drought. In this study, a gene encoding EvDREB2A was cloned and characterized in E. vesicaria subsp sativa. The full-length EvDREB2A cDNA sequence contained a 388-bp 5'-untranslated region (UTR), a 348-bp 3'-UTR, and a 1002-bp open reading frame that encoded 334 amino acid residues. The theoretical isoelectric point of the EvDREB2A protein was 4.80 and the molecular weight was 37.64 kDa. The genomic sequence of EvDREB2A contained no introns. Analysis using SMART indicated that EvDREB2A contains a conserved AP2 domain, similar to other plant DREBs. Phylogenetic analysis revealed that EvDREB2A and DREB2As from Brassica rapa, Eutrema salsugineum, Arabidopsis thaliana, Arabidopsis lyrata, and Arachis hypogaea formed a small subgroup, which clustered with DREB2Bs from A. lyrata, A. thaliana, Camelina sativa, and B. rapa to form a larger subgroup. EvDREB2A is most closely related to B. rapa DREB2A, followed by DREB2As from E. salsugineum, A. thaliana, A. hypogaea, and A. lyrata. A quantitative real-time polymerase chain reaction indicated that EvDREB2A expression was highest in the leaves, followed by the roots and hypocotyls, and was lowest in the flower buds. EvDREB2A could be used to improve drought tolerance in crops.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,331

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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