Investigating the Molecular Effects of Superovulation and Embryo Culture on Genomic Imprinting in a Mouse Model System.
Notice bibliographique
Résumé
Genomic imprinting is a specialized transcriptional mechanism that results in the unequal expression of alleles based on their parent-of-origin. Many imprinted genes have been shown to be critical for proper embryonic and fetal development, and disruption of genomic imprinting at these loci has been associated with many development disorders. Recently, increased frequencies of many imprinting disorders have been correlated with the use of assisted reproductive technologies (ARTs). Rigorous and thorough testing of ARTs is required to determine their influence on processes of genomic imprinting. I hypothesize that the acquisition of genomic imprinting in developing germ cells is disrupted by superovulation, and that imprinting maintenance mechanisms are disrupted during early mouse development by culture media used in human ARTs. We have developed a method to evaluate the methylation and expression patterns of known imprinted genes from individual blastocysts. We utilized this technique to separately address the effects of two different hormone dosages, and six different culture media on imprinted methylation and expression. Superovulation resulted in a loss of imprinted methylation at both hormone concentrations tested, in a dose-dependent manner, and embryo culture resulted in a loss of imprinted methylation in all media tested. We conclude that both imprint acquisition and imprint maintenance can be perturbed by assisted reproductive technologies. Further analysis and use of our novel technique will allow more accurate and comprehensive study of the epigenetic effects of various environmental insults on the preimplantation embryo. (poster)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».