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Enregistrement W2539704783 · doi:10.1093/biolreprod/81.s1.266

Investigating the Molecular Effects of Superovulation and Embryo Culture on Genomic Imprinting in a Mouse Model System.

2009· article· en· W2539704783 sur OpenAlexaff
Brenna A. Market-Velker, Lauren S. Magri, Anne C. Bonvissuto, Mellissa R.W. Mann

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenomic imprintingImprinting (psychology)BiologyEpigeneticsDNA methylationEmbryoGeneticsEmbryonic stem cellMethylationEmbryo cultureGeneEmbryogenesisGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genomic imprinting is a specialized transcriptional mechanism that results in the unequal expression of alleles based on their parent-of-origin. Many imprinted genes have been shown to be critical for proper embryonic and fetal development, and disruption of genomic imprinting at these loci has been associated with many development disorders. Recently, increased frequencies of many imprinting disorders have been correlated with the use of assisted reproductive technologies (ARTs). Rigorous and thorough testing of ARTs is required to determine their influence on processes of genomic imprinting. I hypothesize that the acquisition of genomic imprinting in developing germ cells is disrupted by superovulation, and that imprinting maintenance mechanisms are disrupted during early mouse development by culture media used in human ARTs. We have developed a method to evaluate the methylation and expression patterns of known imprinted genes from individual blastocysts. We utilized this technique to separately address the effects of two different hormone dosages, and six different culture media on imprinted methylation and expression. Superovulation resulted in a loss of imprinted methylation at both hormone concentrations tested, in a dose-dependent manner, and embryo culture resulted in a loss of imprinted methylation in all media tested. We conclude that both imprint acquisition and imprint maintenance can be perturbed by assisted reproductive technologies. Further analysis and use of our novel technique will allow more accurate and comprehensive study of the epigenetic effects of various environmental insults on the preimplantation embryo. (poster)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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