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Enregistrement W2540438346 · doi:10.1002/chem.201603956

Mechanistic Study of the Stereoselective Hydroxylation of [2‐<sup>2</sup>H<sub>1</sub>,3‐<sup>2</sup>H<sub>1</sub>]Butanes Catalyzed by Cytochrome P450 BM3 Variants

2016· article· en· W2540438346 sur OpenAlexaff
Chung‐Ling Yang, Cheng‐Hung Lin, Wen‐I Luo, Tsu‐Lin Lee, R. Ramu, Kok Yaoh Ng, Yi‐Fang Tsai, Guor‐Tzo Wei, Steve S.‐F. Yu

Notice bibliographique

RevueChemistry - A European Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMetal-Catalyzed Oxygenation Mechanisms
Établissements canadiensEmergent BioSolutions (Canada)
Organismes subventionnairesAcademia Sinica
Mots-clésStereoselectivityHydroxylationStereochemistryCatalysisChemistryPhysicsOrganic chemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Engineered bacterial cytochrome P450s are noted for their ability in the oxidation of inert small alkanes. Cytochrome P450 BM3 L188P A328F (BM3 PF) and A74E L188P A328F (BM3 EPF) variants are able to efficiently oxidize n‐butane to 2‐butanol. Esterification of the 2‐butanol derived from this reaction mediated by the aforementioned two mutants gives diastereomeric excesses (de) of −56±1 and −52±1 %, respectively, with the preference for the oxidation occurring at the C−HS bond. When tailored (2R,3R)‐ and (2S,3S)‐[2‐2H1,3‐2H1]butane probes are employed as substrates for both variants, the obtained de values from (2R,3R)‐[2‐2H1,3‐2H1]butane are −93 and −92 % for BM3 PF and EPF, respectively; whereas the obtained de values from (2S,3S)‐[2‐2H1,3‐2H1]butane are 52 and 56 % in the BM3 PF and EPF systems, respectively. The kinetic isotope effects (KIEs) for the oxidation of (2R,3R)‐[2‐2H1,3‐2H1]butane are 7.3 and 7.8 in BM3 PF and EPF, respectively; whereas KIEs for (2S,3S)‐[2‐2H1,3‐2H1]butanes are 18 and 25 in BM3 PF and EPF, respectively. The discrepancy in KIEs obtained from the two substrates supports the two‐state reactivity (TSR) that is proposed for alkane oxidation in cytochrome P450 systems. Moreover, for the first time, experimental evidence for tunneling in the oxidation mediated by P450 is given through the oxidation of the C−HR bond in (2S,3S)‐[2‐2H1,3‐2H1]butane.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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