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Enregistrement W2542315660 · doi:10.1111/1751-7915.12432

<i>Actinobacillus pleuropneumoniae</i> grows as aggregates in the lung of pigs: is it time to refine our <i>in vitro</i> biofilm assays?

2016· article· en· W2542315660 sur OpenAlexafffund
Yannick D. N. Tremblay, Josée Labrie, Sonia Chénier, Mario Jacques

Notice bibliographique

RevueMicrobial Biotechnology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensMinistère de l'Agriculture, des Pêcheries et de l'AlimentationUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésActinobacillus pleuropneumoniaeBiofilmMicrobiologyPleuropneumoniaIn vitroActinobacillusChemistryAgaroseIn vivoConfocalBiologyBacteriaMolecular biologySerotypeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Actinobacillus pleuropneumoniae causes porcine pleuropneumonia and forms biofilms in vitro on abiotic surfaces; however, presence of biofilms during infections has not been documented. The aim of this study was to use a species-specific fluorescent oligonucleotide probe and confocal microscopy to localize A. pleuropneumoniae in the lungs of two naturally infected pigs. Actinobacillus pleuropneumoniae was detected by fluorescence in situ hybridization and observed to grow as aggregates (~30-45 μm) during a natural infection. As the A. pleuropneumoniae aggregates observed in porcine lungs differed from the biofilms grown on a solid surface obtained in vitro, we designed a new biofilm assay using agarose, a porous substrate, favouring the formation of aggregates. In this study, we described for the first time the mode of growth of A. pleuropneumoniae during a natural infection in pigs. We also propose an in vitro biofilm assay for A. pleuropneumoniae using a porous substrate which allows the formation of aggregates. This assay might be more representative of the in vivo situation, at least in terms of the size of the bacterial aggregates and the presence of a porous matrix, and could potentially be used to test the susceptibility of A. pleuropneumoniae aggregates to antibiotics and disinfectants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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