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Enregistrement W2542536891 · doi:10.1074/jbc.m116.758821

The Cytoplasmic Region of Inner Helix S6 Is an Important Determinant of Cardiac Ryanodine Receptor Channel Gating

2016· article· en· W2542536891 sur OpenAlexaff
Bo Sun, Wenting Guo, Xixi Tian, Jinjing Yao, Lin Zhang, Ruiwu Wang, S.R. Wayne Chen

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRyanodine receptor 2Ryanodine receptorGatingCytoplasmHelix (gastropod)Helix bundleMutantCell biologyBiophysicsBiologyChemistryEndoplasmic reticulumProtein structureBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ryanodine receptor (RyR) channel pore is formed by four S6 inner helices, with its intracellular gate located at the S6 helix bundle crossing region. The cytoplasmic region of the extended S6 helix is held by the U motif of the central domain and is thought to control the opening and closing of the S6 helix bundle. However, the functional significance of the S6 cytoplasmic region in channel gating is unknown. Here we assessed the role of the S6 cytoplasmic region in the function of cardiac RyR (RyR2) via structure-guided site-directed mutagenesis. We mutated each residue in the S6 cytoplasmic region of the mouse RyR2 ( 4876 QQEQVKEDM 4884 ) and characterized their functional impact. We found that mutations Q4876A, V4880A, K4881A, and M4884A, located mainly on one side of the S6 helix that faces the U motif, enhanced basal channel activity and the sensitivity to Ca 2+ or caffeine activation, whereas mutations Q4877A, E4878A, Q4879A, and D4883A, located largely on the opposite side of S6, suppressed channel activity. Furthermore, V4880A, a cardiac arrhythmia-associated mutation, markedly enhanced the frequency of spontaneous openings and the sensitivity to cytosolic and luminal Ca 2+ activation of single RyR2 channels. V4880A also increased the propensity and reduced the threshold for arrhythmogenic spontaneous Ca 2+ release in HEK293 cells. Collectively, our data suggest that interactions between the cytoplasmic region of S6 and the U motif of RyR2 are important for stabilizing the closed state of the channel. Mutations in the S6/U motif domain interface likely destabilize the closed state of RyR2, resulting in enhanced basal channel activity and sensitivity to activation and increased propensity for spontaneous Ca 2+ release and cardiac arrhythmias.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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