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Enregistrement W2544842137 · doi:10.1002/iub.1562

Mutant form<scp>C</scp>115<scp>H</scp>of<scp><i>C</i></scp><i>lostridium sporogenes</i>methionine γ‐lyase efficiently cleaves<scp>S</scp>‐Alk(en)yl‐<scp>l</scp>‐cysteine sulfoxides to antibacterial thiosulfinates

2016· article· en· W2544842137 sur OpenAlexfundno aff
Vitalia V. Kulikova, Natalya V. Anufrieva, Svetlana V. Revtovich, А. С. Чернов, G. B. Telegin, Elena A. Morozova, Tatyana V. Demidkina

Notice bibliographique

RevueIUBMB Life · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGarlic and Onion Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsRussian Science Foundation
Mots-clésCysteineChemistryEnzymeBiochemistryClostridium sporogenesLyaseMutantMethionineEnzyme assayBacteriaStereochemistryClostridiumBiologyAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pyridoxal 5'-phosphate-dependent methionine γ-lyase (MGL) catalyzes the β-elimination reaction of S-alk(en)yl-l-cysteine sulfoxides to thiosulfinates, which possess antimicrobial activity. Partial inactivation of the enzyme in the course of the reaction occurs due to oxidation of active site cysteine 115 conserved in bacterial MGLs. In this work, the C115H mutant form of Clostridium sporogenes MGL was prepared and the steady-state kinetic parameters of the enzyme were determined. The substitution results in an increase in the catalytic efficiency of the mutant form towards S-substituted l-cysteine sulfoxides compared to the wild type enzyme. We used a sulfoxide/enzyme system to generate antibacterial activity in situ. Two-component systems composed of the mutant enzyme and three S-substituted l-cysteine sulfoxides were demonstrated to be effective against Gram-positive and Gram-negative bacteria and three clinical isolates from mice. © 2016 IUBMB Life, 68(10):830-835, 2016.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,399
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,025
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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