MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2545925691 · doi:10.1021/acsinfecdis.6b00058

Structural and Biochemical Characterization of <i>Acinetobacter</i> spp. Aminoglycoside Acetyltransferases Highlights Functional and Evolutionary Variation among Antibiotic Resistance Enzymes

2016· article· en· W2545925691 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueACS Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésAcetyltransferasesEnzymeBiologyAcetyltransferaseBiochemistryGeneticsMicrobiologySubfamilyGeneAcetylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Modification of aminoglycosides by N-acetyltransferases (AACs) is one of the major mechanisms of resistance to these antibiotics in human bacterial pathogens. More than 50 enzymes belonging to the AAC(6') subfamily have been identified in Gram-negative and Gram-positive clinical isolates. Our understanding of the molecular function and evolutionary origin of these resistance enzymes remains incomplete. Here we report the structural and enzymatic characterization of AAC(6')-Ig and AAC(6')-Ih from Acinetobacter spp. The crystal structure of AAC(6')-Ig in complex with tobramycin revealed a large substrate-binding cleft remaining partially unoccupied by the substrate, which is in stark contrast with the previously characterized AAC(6')-Ib enzyme. Enzymatic analysis indicated that AAC(6')-Ig and -Ih possess a broad specificity against aminoglycosides but with significantly lower turnover rates as compared to other AAC(6') enzymes. Structure- and function-informed phylogenetic analysis of AAC(6') enzymes led to identification of at least three distinct subfamilies varying in oligomeric state, active site composition, and drug recognition mode. Our data support the concept of AAC(6') functionality originating through convergent evolution from diverse Gcn5-related-N-acetyltransferase (GNAT) ancestral enzymes, with AAC(6')-Ig and -Ih representing enzymes that may still retain ancestral nonresistance functions in the cell as provided by their particular active site properties.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,380
Score d'incertitude au seuil0,643

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle