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Enregistrement W2546335501 · doi:10.1182/blood.v110.11.2693.2693

Inhibition of the Thrombin-Thrombomodulin by a Covalent Antithrombin-Heparin.

2007· article· en· W2546335501 sur OpenAlexaff
Maria C. Van Walderveen, Leslie R. Berry, Anthony K.C. Chan

Notice bibliographique

RevueBlood · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntithrombinThrombinThrombomodulinChemistryHeparinIn vivoChondroitin sulfateReaction rate constantCovalent bondSubstrate (aquarium)AnticoagulantProtein CGlycosaminoglycanChromatographyStereochemistryKineticsBiochemistryPlateletInternal medicineImmunologyOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Endothelial thrombin·thrombomodulin (IIa-TM) complex is capable of activating protein C anticoagulant. In vivo, TM can exist in two forms: one with a chondroitin sulfate (CS) (acidic) and one without (non-acidic). TM binding has been shown to reduce the rate of IIa inhibition by antithrombin (AT) in the presence of unfractionated heparin (UFH), especially when the TM possesses a glycosaminoglycan chain. We have recently developed a covalent antithrombin-heparin (ATH) with high potency for inhibition of IIa bound to surfaces. In the present study we examined the role of the CS chain in the inhibition of IIa-TM complex by the novel anticoagulant, ATH, in comparison to AT + UFH. For this study, discontinuous second order rate constant (k2) inhibition assays of IIa-TM were performed at 37°C. IIa was incubated with TM for 30 min and inhibited using either 20nM AT + varying concentrations (0–6000nM) of UFH or a constant concentration of 10nM ATH. Residual IIa activity was measured at 405nm after stopping the reaction using a solution of polybrene and chromogenic substrate (S-2238). Second order rate constants (mean +/− SEM; n≥5) were calculated from plots of IIa-TM activity vs. time and differences determined using two-sample t-tests. Comparison of the second order rate constants for inhibition of IIa, IIa-TM(−CS), or IIa-TM(+CS) by AT + UFH (2.015 × 108 +/− 7.079 × 106 M−1min−1, 1.633 × 108 +/− 8.922 × 106 M−1min−1, and 5.248 × 107 +/− 5.693 × 106 M−1min−1, respectively) showed that the presence of TM reduced the rate of inhibition (with respect to IIa alone; p=0.012, p<0.001, respectively). Moreover, the presence of a CS on the TM inhibited IIa neutralization to a greater degree than when the CS is absent (p<0.001). Furthermore, ATH was a much faster inhibitor of IIa, IIa-TM(−CS), and TM(+CS) (1.486 × 109 +/− 1.193 × 108 M−1min−1, 1.370 × 109 +/− 1.246 × 108 M−1min−1, and 8.869 × 108 +/− 1.246 × 108 M−1min−1, respectively) compared to AT + UFH (p<0.001). CS removal by chondroitin ABC lyase (ABCase) showed that the rate of IIa-TM(+CS) inhibition significantly increased for both AT + UFH and ATH, while no significant change due to ABCase treatment was found for the rate of inhibition of IIa-TM(−CS) by either AT + UFH or ATH. We speculate that during IIa-TM(+CS) inhibition by ATH, the covalently linked heparin moiety may be able to repel (rotate) the CS chain in order for ATH to interact with the IIa-TM complex. In the case of AT + UFH, lack of permanent UFH linkage to AT may allow the CS to displace the UFH chain from binding both AT and IIa. Steric hindrance by CS chains remains a significant factor since the k2 values were lower for the AT + UFH or ATH reactions with IIa-TM(+CS) compared to those with IIa-TM(−CS). Given the rapid reaction rate with free or bound IIa, ATH significantly limits availability of IIa for coagulant or anticoagulant functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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