Prediction of long-term survival using expression of FOXA1, a determinant of estrogen response domains in breast cancer
Notice bibliographique
Résumé
539 Background: Recent studies have demonstrated cofactor dependency of estrogen receptor alpha (ERα) in defining specific pattern of estrogen (E2) response in breast cancer. FOXA1, also called HNF3α, a forkhead family transcription factor, has emerged as a major cofactor that is essential for optimum transcription of ∼50% of ERα:E2 responsive genes. FOXA1 is expressed in breast cancer cells and in cDNA microarray cluster analysis segregates with genes that characterize the luminal A subtype such as ERα, GATA3, and XBP-1. Detailed expression analysis of FOXA1 in human breast tumors has not been previously performed and it is not known whether it is an independent prognostic factor in breast cancer. Methods: A tissue microarray comprising tumors from 438 patients with 20 years follow-up was analyzed for FOXA1 expression using goat-anti-human FOXA1 antibody by immunohistochemistry. Percentage (P) and intensity (I) of expression was analyzed to generate numerical score (S= P × I). FOXA1 expression was correlated with tumor grade, nodal status, disease free survival, and expression of ER, PR, GATA3, HER2, p27 kip1 , phospho-AKT, and luminal A subtype (defined as ER &/or PR+, bcl-2+ and Her-2-neg). Results: FOXA1 expression (score greater than 100) was seen in 187 of 438 breast cancers and correlated with greater likelihood of survival at 20 year (p=0.0114). A significant positive correlation was observed between FOXA1 expression and expression of ERα (p= 0.000001), GATA3 (p= 0.000001), PR (p= 0.00001), phospho-AKT (p= 0.00001). Similarly, a significant correlation was noted with luminal A subtype. An inverse correlation was noted with tumor grade and mdm-2 expression (p=0.00001). HER2 or p27 kip1 expression and nodal status showed no correlation with FOXA1. Conclusions: FOXA1 is good prognostic marker predicting disease free survival in patients with breast cancer. Since its expression correlates well with breast cancer of luminal A subtype, it can also be used to identify these good prognosis tumors from the rest of the ER positive breast cancers in archival paraffin embedded breast tissues. No significant financial relationships to disclose.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».