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Enregistrement W2546736938 · doi:10.1186/s12885-016-2886-9

Response biomarkers: re-envisioning the approach to tailoring drug therapy for cancer

2016· review· en· W2546736938 sur OpenAlexaff
Shahil Amin, Oliver F. Bathe

Notice bibliographique

RevueBMC Cancer · 2016
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensUniversity of CalgaryAlberta Bone and Joint Health Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBiomarkerIntensive care medicineDrugDrug developmentRisk analysis (engineering)Pharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The rapidly expanding arsenal of chemotherapeutic agents approved in the past 5 years represents significant progress in the field. However, this poses a challenge for oncologists to choose which drug or combination of drugs is best for any individual. Because only a fraction of patients respond to any drug, efforts have been made to devise strategies to personalize care. The majority of efforts have involved development of predictive biomarkers. While there are notable successes, there are no predictive biomarkers for most drugs. Moreover, predictive biomarkers enrich the cohort of individuals likely to benefit; they do not guarantee benefit. MAIN TEXT: There is a need to devise alternate strategies to tailor cancer care. One alternative approach is to enhance the current adaptive approach, which involves administration of a drug and cessation of treatment once progression is documented. This currently involves radiographic tests for the most part, which are expensive, inconvenient and imperfect in their ability to categorize patients who are and are not benefiting from treatment. A biomarker approach to categorizing response may have advantages. CONCLUSION: Herein, we discuss the state of the art on treatment response assessment. While the most mature technologies for response assessment involve radiographic tests such as CT and PET, reports are emerging on biomarkers used to monitor therapeutic efficacy. Potentially, response biomarkers represent a less expensive and more convenient means of monitoring therapy, although an ideal response biomarker has not yet been described. A framework for future response biomarker discovery is described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,024
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,026
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,129

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0240,026
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0010,007
Communication savante0,0070,010
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0060,013
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,414
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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