Regulation of Vegetative Phase Change by SWI2/SNF2 Chromatin Remodeling ATPase BRAHMA
Notice bibliographique
Résumé
Plants progress from a juvenile vegetative phase of development to an adult vegetative phase of development before they enter the reproductive phase. miR156 has been shown to be the master regulator of the juvenile-to-adult transition in plants. However, the mechanism of how miR156 is transcriptionally regulated still remains elusive. In a forward genetic screen, we identified that a mutation in the SWI2/SNF2 chromatin remodeling ATPase BRAHMA (BRM) exhibited an accelerated vegetative phase change phenotype by reducing the expression of miR156, which in turn caused a corresponding increase in the levels of SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN LIKE genes. BRM regulates miR156 expression by directly binding to the MIR156A promoter. Mutations in BRM not only increased occupancy of the -2 and +1 nucleosomes proximal to the transcription start site at the MIR156A locus but also the levels of trimethylated histone H3 at Lys 27. The precocious phenotype of brm mutant was partially suppressed by a second mutation in SWINGER (SWN), but not by a mutation in CURLEY LEAF, both of which are key components of the Polycomb Group Repressive Complex 2 in plants. Our results indicate that BRM and SWN act antagonistically at the nucleosome level to fine-tune the temporal expression of miR156 to regulate vegetative phase change in Arabidopsis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».