Toward defining deep brain stimulation targets in MNI space: A subcortical atlas based on multimodal MRI, histology and structural connectivity
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Three-dimensional atlases of subcortical brain structures are valuable tools to reference anatomy in neuroscience and neurology. In the special case of deep brain stimulation (DBS), the three most common targets are the subthalamic nucleus (STN), the internal part of the pallidum (GPi) and the ventral intermediate nucleus of the thalamus (VIM). With the help of atlases that define the position and shape of these target regions within a well-defined stereotactic space, their spatial relationship to implanted deep brain stimulation (DBS) electrodes may be determined. Here we present a composite atlas based on manual segmentations of a multi-modal high-resolution MNI template series, histology and structural connectivity. To attain exact congruence to the template anatomy, key structures were defined using all four modalities of the template simultaneously. In a first step tissue probability maps were defined based on the multimodal intensity profile of each structure. These observer-independent probability maps provided an excellent basis for the subsequent manual segmentation particularly when defining the outline of the target regions. Second, the key structures were used as an anchor point to coregister a histology based atlas into standard space. Finally, a sub-segmentation of the subthalamic nucleus into three functional zones was estimated based on structural connectivity. The resulting composite atlas uses the spatial information of the MNI template for DBS key structures that are visible on the template itself. For remaining structures, it relies on histology or structural connectivity. In this way the final atlas combines the anatomical detail of a histology based atlas with the spatial accuracy of key structures in relationship to the template anatomy. Thus, the atlas provides an ideal tool for the analysis of DBS electrode placement. Highlights: Composite subcortical atlas based on a multimodal, high definition MNI template series, histology and tractography High definition atlas of DBS targets exactly matching MNI 152 NLIN 2009b space Multimodal subcortical segmentation algorithm applied to MNI template
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».