Deregulation of small non-coding RNAs at the <i>DLK1-DIO3</i> imprinted locus predicts lung cancer patient outcome
Notice bibliographique
Résumé
// Katey S.S. Enfield 1 , Victor D. Martinez 1 , Erin A. Marshall 1 , Greg L. Stewart 1 , Sonia H.Y. Kung 1 , Jhon R. Enterina 1 , Wan L. Lam 1 1 Department of Integrative Oncology, British Columbia Cancer Research Centre, Vancouver, B.C. V5Z 1L3, Canada Correspondence to: Katey S.S. Enfield, email: kenfield@bccrc.ca Keywords: DLK1-DIO3, imprinted locus, lung cancer, microRNA, piwi-interacting RNA Received: September 02, 2016 Accepted: October 27, 2016 Published: November 05, 2016 ABSTRACT Deregulation of the imprinted DLK1 - DIO3 locus at chromosome 14q32.1-14q32.31 has been associated with developmental and respiratory disorders, including cancer. In lung cancer, deregulation of imprinting at DLK1 - DIO3 was recently described in smokers. Deregulated expression of a microRNA (miRNA) cluster mapping to this locus was also associated with patient outcome, suggesting the importance of this locus to lung cancer disease phenotypes. The DLK1 - DIO3 locus is complex, and encodes several protein-coding genes, in addition to long and short non-coding RNAs. While the role of miRNAs is established, the biological importance of another relevant class of small RNAs, PIWI-interacting RNAs (piRNAs), has not been investigated. When somatically expressed, piRNAs regulate gene transcription through DNA methylation. Interestingly, their expression patterns have been observed to be altered in cancer and correlated with patient outcome. Here, we characterize the somatic expression of piRNAs encoded at DLK1 - DIO3 in two independent cohorts of lung adenocarcinoma and lung squamous cell carcinoma and investigate their associations with patient outcome. We find that the expression of piRNAs encoded at DLK1-DIO3 enhances the prognostic potential of small non-coding RNAs specific to this locus in predicting patient outcome, further emphasizing the importance of regulation at this locus in lung cancer.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
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| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
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