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Enregistrement W2547511922

Profiling changes in the metastatic potential of breast cancer cells exposed to flow

2012· article· en· W2547511922 sur OpenAlexaffvenue
Brayden K. Kooistra

Notice bibliographique

RevueJournal of undergraduate research in Alberta · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMetastasisEpithelial–mesenchymal transitionCancer researchBiologyCancer cellCellAnoikisCirculating tumor cellCancerCell adhesionDownregulation and upregulationTumor progressionMetastatic breast cancerPathologyMesenchymal stem cellBreast cancerCell biologyMedicineGeneGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most cancer related deaths can be directly attributed to blood bourne metastasis.Metastasis is the process by which tumor cells leave the initial tumor travel through thecirculatory or lymphatic system to distant sites where secondary tumors are formed.One important part of metastasis is epithelial to mesenchymal transition (EMT), inwhich cells lose their epithelial cell morphology and gain a mesenchymal morphology.This transition causes enhanced migratory capacity, invasiveness, and resistance tocell death, creating a more metastatic cell. In this study we used a parallel plate flowchamber to create conditions that would encourage EMT in breast cancer cells. Severalbreast cancer cell lines were exposed to high shear stress (10 dyn/cm2) for 20 hours.RNA was collected from static and flow exposed cells. RT-qPCR was used to comparethe expression of four genes known to be related to EMT or cell invasiveness. Wefound that TSP-1 gene expression was strongly upregulated, MMP-14 was slightlyupregulated, ICAM-1 was slightly downregulated, and TGFR1 gene expression didnot change. TSP-1 has been shown to increase tumor cell migration and invasivenessand MMP-14 has also been associated with increased tumor cell invasiveness. ICAM-1is an intercellular adhesion molecule that plays different roles in cell to cell adhesion.The loss of ICAM-1 and the up regulation of TSP-1 and MMP-14 show that the cellsexposed to flow lose some intercellular interaction and gain increased mobility andinvasiveness, all of which is indicative of EMT. These results show for the first timethat fluid forces can upregulate genes involved in cancer cell EMT. This will be used infuture studies to investigate more about the metastatic potential of breast cancer cells.11

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,091
Tête enseignante GPT0,390
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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