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Enregistrement W2547879761 · doi:10.1186/s13023-016-0519-7

Increased Wnt and Notch signaling: a clue to the renal disease in Schimke immuno-osseous dysplasia?

2016· article· en· W2547879761 sur OpenAlexafffund
Marie Morimoto, Clara Myung, Kimberly Beirnes, Kunho Choi, Yumi Asakura, Arend Bökenkamp, Dominique Bonneau, Milena Brugnara, Joel Charrow, Estelle Colin, Amira Davis, Georges Deschênes, Mattia Gentile, Mario Giordano, Andrew K. Gormley, Rajeshree Govender, Mark Joseph, Kory Keller, Evelyne Lerut, Elena Levtchenko, Laura Massella, Christy Mayfield, Behzad Najafian, David M. Parham, Jürgen W. Spranger, Peter Stenzel, Uluç Yiş, Zhongxin Yu, Jonathan Zonana, Glenda Hendson, Cornelius F. Boerkoel

Notice bibliographique

RevueOrphanet Journal of Rare Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensChildren's & Women's Health Centre of British ColumbiaChild and Family Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentCanadian Institutes of Health ResearchInstitute of Human Development, Child and Youth HealthHospital for Sick ChildrenUniversity of British ColumbiaNational Institutes of HealthMichael Smith Health Research BC
Mots-clésWnt signaling pathwayNotch signaling pathwayPathogenesisMedicineFocal segmental glomerulosclerosisKidneyCancer researchBiologyGenePathologyGeneticsInternal medicineGlomerulonephritis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Schimke immuno-osseous dysplasia (SIOD) is a multisystemic disorder caused by biallelic mutations in the SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily A-like 1 (SMARCAL1) gene. Changes in gene expression underlie the arteriosclerosis and T-cell immunodeficiency of SIOD; therefore, we hypothesized that SMARCAL1 deficiency causes the focal segmental glomerulosclerosis (FSGS) of SIOD by altering renal gene expression. We tested this hypothesis by gene expression analysis of an SIOD patient kidney and verified these findings through immunofluorescent analysis in additional SIOD patients and a genetic interaction analysis in Drosophila. RESULTS: We found increased expression of components and targets of the Wnt and Notch signaling pathways in the SIOD patient kidney, increased levels of unphosphorylated β-catenin and Notch1 intracellular domain in the glomeruli of most SIOD patient kidneys, and genetic interaction between the Drosophila SMARCAL1 homologue Marcal1 and genes of the Wnt and Notch signaling pathways. CONCLUSIONS: We conclude that increased Wnt and Notch activity result from SMARCAL1 deficiency and, as established causes of FSGS, contribute to the renal disease of most SIOD patients. This further clarifies the pathogenesis of SIOD and will hopefully direct potential therapeutic approaches for SIOD patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,789
Score d'incertitude au seuil0,603

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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