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Enregistrement W2548486833 · doi:10.1111/mmi.13569

ProP‐ProP and ProP‐phospholipid interactions determine the subcellular distribution of osmosensing transporter ProP in <scp><i>E</i></scp><i>scherichia coli</i>

2016· article· en· W2548486833 sur OpenAlexaff
Tatyana Romantsov, Doreen E. Culham, Tavia Caplan, Jennifer Garner, Robert S. Hodges, Janet M. Wood

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySubcellular localizationCytoplasmBiochemistryCell biologyTransmembrane domainTransporterBiophysicsAmino acidGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Osmosensing transporter ProP protects bacteria from osmotically induced dehydration by mediating the uptake of zwitterionic osmolytes. ProP activity is a sigmoidal function of the osmolality. ProP orthologues share an extended, cytoplasmic C-terminal domain. Orthologues with and without a C-terminal, α-helical coiled-coil domain respond similarly to the osmolality. ProP concentrates at the poles and septa of Escherichia coli cells in a cardiolipin (CL)-dependent manner. The roles of phospholipids and the C-terminal domain in subcellular localization of ProP were explored. Liposome association of peptides representing the C-terminal domains of ProP orthologues and variants in vitro was compared with subcellular localization of the corresponding orthologues and variants in vivo. In the absence of coiled-coil formation, the C-terminal domain bound liposomes and ProP concentrated at the cell poles in a CL-independent manner. The presence of the coiled-coil replaced those phenomena with CL-dependent binding and localization. The effects of amino acid replacements on lipid association of the C-terminal peptide fully recapitulated their effects on the subcellular localization of ProP. These data suggest that polar localization of ProP results from association of its C-terminal domain with the anionic lipid-enriched membrane at the cell poles. The coiled-coil domain present on only some orthologues renders that phenomenon CL-dependent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,068
Score d'incertitude au seuil0,813

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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