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Enregistrement W2548583894 · doi:10.1089/gtmb.2016.0054

Association Between the <i>FokI</i> and <i>ApaI</i> Polymorphisms in the Vitamin D Receptor Gene and Intervertebral Disc Degeneration: A Systematic Review and Meta-Analysis

2016· review· en· W2548583894 sur OpenAlexaff
Noel Pabalan, Lani Tabangay, Hamdi Jarjanazi, Luiz Ângelo Vieira, Aline Amaro dos Santos, Caio Parente Barbosa, Luciano Miller Reis Rodrigues, Bianca Bianco

Notice bibliographique

RevueGenetic Testing and Molecular Biomarkers · 2016
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSpine and Intervertebral Disc Pathology
Établissements canadiensMinistry of the Environment, Conservation and Parks
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésFokICalcitriol receptorMeta-analysisOdds ratioInternal medicineGenotypeConfidence intervalSubgroup analysisBiologyMedicineVitamin D and neurologyGastroenterologyGeneticsPolymorphism (computer science)Gene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Evidence supporting an association of intervertebral disc degeneration (DD) with polymorphisms of the vitamin D receptor (VDR) gene has been controversial. We performed a meta-analysis of these studies to determine if there was substantial evidence to support such an association between the VDR polymorphisms and DD. Methods: PubMed, Embase, and Science Direct databases were searched for studies that investigated associations of the FokI (rs2228570, rs10735810), and ApaI (rs7975253) polymorphisms of the VDR gene with DD. From the extracted genotype data from 14 publications, we estimated risk (odds ratio [OR] with 95% confidence intervals). Results: Overall associations of FokI with DD were absent (OR 0.96–1.04, p = 0.73–0.95) with heterogeneity in the dominant and codominant models (pheteroegeneity <0.10, I2 = 47–57%). Post-outlier pooled effects yielded dominant significance indicating reduced risk (OR 0.77, p = 0.01) with concomitant zero heterogeneity (I2 = 0%). ApaI effects pointed to reduced risks, with overall dominant significance (OR 0.69, p = 0.04) and Asian subgroup nonsignificance (OR 0.75–0.93, p = 0.17–0.74). In FokI, Non-Hispanic Caucasians (OR 0.77, p = 0.01) and males (OR 0.36–0.66, p = 0.001–0.04) were protected but not Hispanic Caucasians (OR 1.39–1.85, p = 0.006–0.05) and females (OR 1.72, p = 0.05). Tests of interaction between the genders highlighted female susceptibility and male protection (p = 0.001–0.005). Zero heterogeneity (I2 = 0%) is a key strength of these significant effects. Conclusion: This meta-analysis confirmed the protective role of the ApaI polymorphism, however, susceptibility and protective effects of the FokI polymorphism may be ethnic and gender specific.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,029
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,071

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,029
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0170,031
Bibliométrie0,0070,009
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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